Новый подход к генетическому тестированию родства в якутской археологии
Аннотация
В течение пятнадцати лет изучались генетические взаимосвязи между людьми, жившими сотни или тысячи лет назад, чьи останки были обнаружены в одиночных могилах или крупных погребальных комплексах. Изучение родства древних якутов позволило определить трудности в анализе генетических данных для небольших древних человеческих популяций и разработать стратегию повышения точности статистических вычислений. В статье описывается эта стратегия и возможные пути решения проблем при изучении небольших популяций, для которых нет референсных данных по глобальным мета-популяциям, что обусловлено их изоляцией расстоянием или древностью.
Об авторах
В. Звенигороски
Институт судебной медицины, Университет Страсбурга
Франция
Франция
Звенигороски Винсент
С. А. Федорова
СВФУ им. М.К. Аммосова; ЯНЦ КМП
Россия
Россия
Федорова Сардана Аркадьевна – д.б.н., зав. лаб. Института естественных наук ; с.н.с.
К. Холлард
Институт судебной медицины, Университет Страсбурга
Франция
Франция
Hollard Clémence
А. Гонзалес
Институт судебной медицины, Университет Страсбурга
Франция
Франция
Gonzalez Angéla
А. Н. Алексеев
Россия
Алексеев Анатолий Николаевич – д.и.н., проф., науч. руковод. Ин-та гуманитарных исследований и проблем малочисленных народов Севера СО РАН
Р. И. Бравина
Россия
Бравина Розалия Иннокентьевна – д.и.н., проф., зав. сектором археологии ИГИиПМНС СО РАН
Э. Крюбези
Университет Тулузы им. П. Сабатье
Франция
Франция
Crubézy Eric – зав. лаб. молекулярной антропологии, Университет Тулузы им. П. Сабатье
К. Кейзер
Институт судебной медицины, Университет Страсбурга
Франция
Франция
Keyser Christine
Список литературы
1. Ancient DNA Reveals Male Diffusion through the Neolithic Mediterranean Route / M. Lacan [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences 108, №o 24.– June 2011: 9788 91, doi:10.1073/pnas.1100723108.
2. Blouin Michael S. DNA-Based Methods for Pedigree Reconstruction and Kinship Analysis in Natural Populations / Blouin Michael S. // Trends in Ecology & Evolution 18, № 10.– October 2003: 503 11, doi:10.1016/S0169-5347(03)00225-8.
3. Excoffier L. Arlequin Suite Ver 3.5: A New Series of Programs to Perform Population Genetics Analyses under Linux and Windows / Excoffier L. et Lischer Heidi E. L.// Molecular Ecology Resources 10, № 3.– May 2010: 564 67, doi:10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x.
4. First Application of the Investigator DIPplex Indels Typing Kit for the Analysis of Ancient DNA Samples / C. Hollard [et al.] // Forensic Science International: Genetics Supplement Series 3, № 1.– December 2011): e393 94, doi:10.1016/j.fsigss.2011.09.058.
5. Genetic analysis of human remains from a double inhumation in a frozen kurgan in Kazakhstan (Berel site, Early 3rd Century BC) / Clisson [et al.] // Int J Legal Med. – 2002.
6. Genetic Diversity of a Late Prehispanic Group of the Quebrada de Humahuaca, Northwestern Argentina: DNA from Ancient Northwestern Argentineans / Fanny Mendisco [et al.] // Annals of Human Genetics 78, №5.– September 2014: 367 80, doi:10.1111/ahg.12075.
7. GENETIX 4.0. 5.2., Software under WindowsTM for the genetics of the populations / K. Belkhir [et al.]. – 2004.
8. Integrative genomics viewer / James T Robinson [et al.] // Nature Biotechnology 29, №1.– January 2011): 24 26, doi:10.1038/nbt.1754.
9. Jacquard A. Génétique des populations humaines / Jacquard Albert et Chaventré André // Presses universitaires de France, 1974.
10. Keyser-Tracqui C. Nuclear and Mitochondrial DNA Analysis of a 2,000-Year-Old Necropolis in the Egyin Gol Valley of Mongolia / Keyser-Tracqui Christine, Crubézy Eric, Ludes Bertrand // The American Journal of Human Genetics 73, № 2. – August 2003: 247 60, doi:10.1086/377005.
11. Kalinowski S.T. Ml-Relate: A Computer Program for Maximum Likelihood Estimation of Relatedness and Relationship / Kalinowski Steven T., Wagner Aaron P. , Taper Mark L.// Molecular Ecology Notes 6, №o 2. – June 2006: 576 79, doi:10.1111/j.1471-8286.2006.01256.x.
12. Kling D. Familias 3 – Extensions and New Functionality / Kling Daniel, Tillmar Andreas O., Egeland Thore // Forensic Science International: Genetics 13. – November 2014): 121 27, doi:10.1016/j.fsigen.2014.07.004.
13. The ancient Yakuts: a population genetic enigma / Christine Keyser [et al.] // Philosophical Transactions of the Royal Society of London B: Biological Sciences 370, № 1660. – December 2014. doi:10.1098/rstb.2013.0385.
14. Team R core R: A language and environment for statistical computing // R core Team. – 2014, http://www.R-project.org/.
Рецензия
Для цитирования:
Звенигороски В., Федорова С.А., Холлард К., Гонзалес А., Алексеев А.Н., Бравина Р.И., Крюбези Э., Кейзер К. Новый подход к генетическому тестированию родства в якутской археологии. Якутский медицинский журнал. 2017;(3):16-20.
For citation:
Zvenigoroski V., Fedorova S.A., Hollard K., Gonzales A., Alekseev A., Bravina R.I., Krubesi E., Keizer K. A new approach to genetic kinship testing in Yakut archaeology. Yakut Medical Journal. 2017;(3):16-20.
Просмотров:
0
Послать статью по эл. почте 