Радиомика и радиогеномика рака предстательной железы
https://doi.org/10.25789/YMJ.2021.73.27
Аннотация
В обзоре литературы на примере рака предстательной железы рассматриваются новые развивающиеся области - радиомика, связанная с извлечением высокопроизводительных данных из количественных характеристик изображений и последующим объединением этой информации с клиническими данными, дающая прогностическую информацию только по характеристикам изображений, и радиогеномика, сопоставляющая полученные особенности изображений с геномными данными. Цель этого обзора - представление последних данных о применении подходов, основанных на радиомике, и обсуждение потенциальной роли радиогеномики при раке предстательной железы, что позволит в дальнейшем разработать новые биомаркеры для диагностики, прогноза и оценки реакции на лечение и получать положительные результаты лечения у пациентов с раком предстательной железы.
Об авторах
М. В. Логинова
ГАУЗ Республиканский клинический онкологический диспансер МЗ Республики Башкортостан;
ФГБОУ ВО Башкирский ГМУ
Россия
Россия
Логинова Мария Владиславовна – врач онколог;
аспирант ИДПО
AuthorID: 1016837
В. Н. Павлов
ФГБОУ ВО БГМУ;
ИДПО
Россия
Россия
Павлов Валентин Николаевич – д.м.н., проф., чл.-корр. РАН, ректор;
зав. Кафедрой
И. Р. Гилязова
ИБГ УФИЦ РАН
Россия
Россия
Гилязова Ирина Ришатовна – к.б.н., доцент, с.н.с.
Список литературы
1. Клинические рекомендации. Рак предстательной железы: стандарты ведения больных для врачей / ред.совет: Общероссийский национальный союз "Ассоциация онкологов России" и др.– М., 2020. – Режим доступа: https://oncology-association.ru/files/clinical-guidelines-2020/rak_predstatelnoj_zhelezy.pdf.
2. Огнерубов Н.А. Радиогеномика и радиомика в диагностике злокачественных опухо лей: обзор литературы/ Огнерубов Н.А., Шатов И.А., Шатов А.В. // Вестник Тамбовского унта. Серия Естествен. и технич. науки. - 2017; 22(6):1453-1460.
3. Ageing populations: the challenges ahead / K Christensen, G Doblhammer, R Rau, et al. // Lancet. – 2009. – Vol.374(9696). - P.1196–208. Doi:10.1016/S0140-6736(09)61460-4.
4. A prostate cancer susceptibility allele at 6q22 increases RFX6 expression by modulating HOXB13 chromatin binding / Q Huang, T Whitington, P Gao, et al. // Nat Genet. - 2014. – Vol.46. – P. 126–135. Doi: 10.1038/ng.2862.
5. Confirmation of the HOXB13 G84E germline mutation in familial prostate cancer / JP Breyer, TG Avritt, KM McReynolds, et al. // Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. - 2012. – Vol. 21. – P. 1348–1353. Doi: 10.1158/1055-9965.EPI-12-0495.
6. Do African-American men need separate prostate cancer screening guidelines? / D Shenoy, S Packianathan, AM Chen, et al. // BMC Urol. - 2016. – Vol. 16. P. 19-27. Doi: 10.1186/s12894-016-0137-7.
7. El Bahassi, M. Next-generation sequencing technologies: breaking the sound barrier of human genetics / M. el Bahassi, P.J. Stambrook // Mutagenesis. – 2014. – Vol.29(5). – P.303–310. Doi: 10.1093/mutage/geu031.
8. Environmental and heritable factors in the causation of cancer— analyses of cohorts of twins from Sweden, Denmark, and Finland / P Lichtenstein, NV Holm, PK Verkasalo, et al // N Engl J Med. - 2000. – Vol.343. – P. 78–85. Doi: 10.1136/thoraxjnl-2015-207921.
9. Exome sequencing of African-American prostate cancer reveals loss-of-function ERF mutations / FW Huang, JM Mosquera, A Garofalo, et al. // Cancer Discov. - 2017. – Vol. 7. – P. 973–983. Doi: 10.1158/2159-8290.CD16-0960.
10. Genomic hallmarks of localized, non-indolent prostate cancer / M Fraser, VY Sabelnykova, TN Yamaguchi, et al. // Nature. - 2017. – Vol. 541. – P. 359–364. Doi: 10.1038/nature20788.
11. Genome-wide association study of prostate cancer identifies a second risk locus at 8q24 / M Yeager, N Orr, RB Hayes, et al // Nat Genet. - 2007. – Vol. 39. – P. 645–649. Doi: 10.1038/ng2022.
12. Guideline for the management of clinically localized prostate cancer: 2007 update / I Thompson, JB Thrasher, G Aus, et al. - J Urol. – 2007. – Vol. 177(6). – P.2106–2131. Doi: 10.1016/j.juro.2007.03.003.
13. Health care costs for state transition models in prostate cancer / MD Krahn, KE Bremner, B Zagorski, et al. // Med Decis Making. – 2014. – Vol.34(3). – P.366–78. Doi: 10.1177/0272989X13493970.
14. Inherited DNA-repair gene mutations in men with metastatic prostate cancer / CC Pritchard, J Mateo, MF Walsh, et al. // N Engl J Med. - 2016. – Vol.375. – P. 443–453. Doi: 10.1056/NEJMoa1603144.
15. Integrative genomic profiling of human prostate cancer / BS Taylor, N Schultz, H Hieronymus, et al. // Cancer Cell. - 2010. – Vol. 18. P. 11–22. Doi: 10.1016/j.ccr.2010.05.026.
16. Integrative clinical genomics of advanced prostate cancer / D Robinson, EM Van Allen, YM Wu, et al. // Cell. - 2015. – Vol. 162. – P. 454 - 462. Doi: 10.1016/j.cell.2015.05.001.
17. MAPS: a quantitative radiomics approach for prostate cancer detection / A Cameron, F Khalvati, MA Haider, et al. // IEEE Trans Biomed Eng. - 2016. – Vol. 63(6). – P.1145–1156. Doi: 10.1109/TBME.2015.2485779.
18. Mazurowski, M.A. Radiogenomics: what it is and why it is important / M.A. Mazurowski // J Am Coll Radiol. – 2015. – Vol. 12(8). –P.862–866. Doi: 10.1016/j.jacr.2015.04.019.
19. Parametric shape modeling using deformable superellipses for prostate segmentation / L Gong, SD Pathak, DR Haynor, et al. // IEEE Trans Med Imaging. - 2004. – Vol. 23(3). – P.340–349. Doi: 10.1109/TMI.2004.824237.
20. PI-RADS prostate imaging–reporting and data system: 2015, version 2 / JC Weinreb, JO Barentsz, PL Choyke, et al. // Eur Urol. - 2016. – Vol. 69(1). – P.16–40. Doi: 10.1016/j.eururo.2015.08.052.
21. Prevalence of incidental prostate cancer: A systematic review of autopsy studies / KJ Bell, C Del Mar, G Wright, et al // Int J Cancer. – 2015. – Vol.137(7). – P.1749–57. Doi: 10.1002/ijc. 29538.
22. Prostate cancer characterization on MR images using fractal features / R Lopes, A Ayache, N Makni, et al. // Med Phys. – 2011. – Vol. 38(1). –P.83–95. Doi: 10.1118/1.3521470.
23. Quantitative monitoring of gene expression patterns with a complementary DNA microarray / M Schena, D Shalon, RW Davis, et al. - Science. – 1995. – Vol.270(5235). –P.467–470. Doi: 10.1126/science.270.5235.467.
24. Quantitative radiomics studies for tissue characterization:a review of technology and methodological procedures / R.T.H.M. Larue, G Defraene, D De Ruysscher, et al. // Br. J.Radiol. - 2017. - Vol. 90. - P. 125-138. Doi: 10.1259/bjr.20160665.
25. Radiomics: extracting more information from medical images using advanced feature analysis / P Lambin, E Rios-Velazquez, R Leijenaar, et al. // Eur J Cancer. - 2012. – Vol.48(4). – P.441–446. Doi: 10.1016/j.ejca.2011.11.036.
26. Radiomics and radiogenomics of prostate cancer / C Smith, P., M Czarniecki, S Mehralivand, et al // Abdominal Radiology. - 2019. – Vol. 44(6). – P.2021-2029. Doi:10.1007/s00261-018-1660-7.
27. Radiomics and radiogenomics for precision radiotherapy / J Wu, KK Tha, L Xing, et al. // J Radiat Res. - 2018. – Vol.59(1). – P.25–31. Doi: 10.1093/jrr/rrx102.
28. Radiomics and radiogenomics in lung cancer: A review for the clinician / R Thawani, M McLane, N Beig, et al. // Lung Cancer. – 2018. – Vol.115. – P.34–41. Doi: 10.1016/j.lungcan.2017.10.015.
29. Radiomics: the process and the challenges / V Kumar, Y Gu, S Basu, et al. // Magn Reson Imaging. – 2012. – Vol. 30(9). – P.1234–1248. Doi: 10.1016/j.mri.2012.06.010.
30. Robust prostate segmentation using intrinsic properties of TRUS images / P Wu, Y Liu, Y Li, et al. // IEEE Trans Med Imaging. – 2015. – Vol. 34(6). – P.1321–1335. Doi: 10.1109/TMI.2015.2388699
31. Rutman, A.M. Radiogenomics: creating a link between molecular diagnostics and diagnostic imaging / A.M Rutman, M.D Kuo // Eur J Radiol. – 2009. – Vol.70(2). –P.232–241. Doi: 10.1016/j.ejrad.2009.01.050.
32. Spatial genomic heterogeneity within localized, multifocal prostate cancer / PC Boutros, M Fraser, NJ Harding, et al. // Nat Genet. – 2015. – Vol. 47(7). – P.736–745. Doi: 10.1038/ng.3315.
33. Systematic population-based assessment of cancer risk in first-degree relatives of cancer probands / DE Goldgar, DF Easton, LA Cannon-Albright, et al // J Natl Cancer Inst. - 1994. – Vol.86. - P: 1600–1608. Doi: 10.1093/jnci/86.21.1600.
34. The genetic epidemiology of prostate cancer and its clinical implications / R Eeles, C Goh, E Castro, et al // Nat Rev Urol. - 2014. – Vol. 11. – P. 18–31. Doi: 10.1038/nrurol.2013.266.
35. The Cancer Genome Atlas Research Network, 2015, https://www.genome.gov/Funded-Programs-Projects/Cancer-Genome-Atlas.
36. U.S. Cancer Statistics Working Group. US cancer statistics: 1999–2009 incidence and mortality webbased report. Atlanta GA: USDHHS, CDC; 2013. http://www.cdc.gov/uscs.
37. World Health Organization. Global Health Observatory data repository. http://apps.who.int/gho/data/view.main.SDG2016LEXREGv?lang=en, accessed [1st July 2017].
38. Zonal segmentation of prostate using multispectral magnetic resonance images / N Makni, A Iancu, O Colot, et al. // Med Phys. - 2011. – Vol. 38(11). – P.6093–6105. Doi: 10.1118/1.3651610.
Рецензия
Для цитирования:
Логинова М.В., Павлов В.Н., Гилязова И.Р. Радиомика и радиогеномика рака предстательной железы. Якутский медицинский журнал. 2021;(1):101-104. https://doi.org/10.25789/YMJ.2021.73.27
For citation:
Loginova M.V., Pavlov V.N., Gilyazova I.R. Radiomics and radiogenomics of prostate cancer. Yakut Medical Journal. 2021;(1):101-104. https://doi.org/10.25789/YMJ.2021.73.27
Просмотров:
16
Послать статью по эл. почте 