Preview

Yakut Medical Journal

Advanced search

Study of genes-candidates polymorphism of susceptibility to tuberculosis in the different ethno-territorial groups of the RF

Abstract

The variability of polymorphic variants of three interleukine genes (rs1143634 in the gene IL1B, rs3212227 in IL12B gene and rs2234663 in the gene IL1RN) in Yakuts is characterized. Associations of studied polymorphic variants with pulmonary tuberculosis in Yakuts are not revealed. A comparison of allele and genotype frequencies between groups of TB patients and between control groups of three ethnoses (Russians, Tuvinians and Yakuts) of Siberia is held. It was shown that the differences between the samples of patients from different ethnic groups were of different nature (variability of allele frequencies and genotypes) than at comparing population samples. These differences in the level of differentiation between groups of patients and control of different ethnicities suggest the existence of racial specificity of the frequency distribution of alleles and genotypes of the investigated genes-candidates of susceptibility to tuberculosis.

About the Authors

N. P. Babushkina
НИИ медицинской генетики ТНЦ СО РАМН
Russian Federation


A. A. Rudko
НИИ медицинской генетики ТНЦ СО РАМН
Russian Federation


M. B. Freidin
НИИ медицинской генетики ТНЦ СО РАМН
Russian Federation


A. N. Kucher
НИИ медицинской генетики ТНЦ СО РАМН
Russian Federation


V. P. Puzyrev
НИИ медицинской генетики ТНЦ СО РАМН
Russian Federation


E. S. Pavlova
НПЦ «Фтизиатрия» МЗ РС (Я)
Russian Federation


E. A. Alexeeva
ЯНЦ КМП СО РАМН
Russian Federation


E. F. Luginova
РДТС по лечебной работе
Russian Federation


A. V. Gorokhov
ЯНЦ КМП СО РАМН
Russian Federation


A. F. Kravchenko
НПЦ «Фтизиатрия» МЗ РС (Я)
Russian Federation


N. R. Maksimova
ЯНЦ КМП; РАМН
Russian Federation


References

1. Антонова Н.В. Научно-организационные основы построения системы мониторинга туберкулеза (социально-гигиеническое исследование): автореф. дис. … канд. мед. наук / Н.В. Антонова. – М., 2007. - 26 с.

2. Имангулова М.М. Полиморфизм кластера гена интерлейкина 1 у больных туберкулезом легких / М.М. Имангулова, А.Р. Бикмаева, Э.К. Хуснутдинова // Цитокины и воспаление. - 2005. - Т. 4. - № 1. - С. 36-41

3. Колоколова О.В. Аллельные варианты генов-кандидатов подверженности туберкулезу у русского населения Западной Сибири: дисс. на соиск. …. канд. мед. наук / О.В. Колоколова. – Томск. – 2005. – 127 с.

4. Кононенко В.Г. Туберкулез легких – эпидемиология и парентеральная химеотерапия. / В.Г. Кононенко, В.А. Шкурупий. – Новосибирск: НЦКЭМ СО РАМН, НГМА. - 2002. – 165 с.

5. Прохоров Б.Б. Окружающая среда и здоровье населения России // Web-Атлас: “Окружающая среда и здоровье населения России”. – 1998. - (http://www.sci.aha.ru/ATL/ra00.htm)

6. Пузырев В.П. Генетическое разнообразие народонаселения и болезни человека / В.П. Пузырев, М.Б. Фрейдин, А.Н. Кучер. – Томск: Изд-во «Печатная мануфактура», 2007. – 320 с.

7. Рудко А.А. Аллельные варианты генов подверженности к туберкулезу у тувинцев: дисс. на соискание …. канд. мед. наук / А.А. Рудко. – Томск, 2004. – 123 с.

8. Система борьбы с туберкулезом в Сибири / Туберкулез – старая проблема в новом тысячелетии / Краснов В.А. [и др.] // Сборник тезисов международной конференции. – М.: «Медицина и жизнь», 2002. – С. 95-97.

9. Урсов И.Г. Эпидемиология туберкулеза и диспансеризация населения. – Новосибирск: ГП «Новосибирский полиграфкомбинат», 2003. – 182 с.

10. A functional promoter variant in IL12B predisposes to cerebral malaria / S. Marquet [et al.] // Human Molecular Genetics. - 2008. - V. 17. - P. 2190–2195.

11. A TaqI polymorphism in the 3’UTR of the IL-12p40 gene correlates with increased IL12 secretion / D. Seegers [et al.] // Genes and immunity. - 2002. - № 3. - P. 419-423.

12. Association of IL12RB1 polymorphisms with susceptibility to and severity of tuberculosis in Japanese: a gene-based association analysis of 21 candidate genes / K. Kusuhara [et al.] // Int J Immunogenet. – 2007. – V. 34. – P. 35-44.

13. Bellamy R. Genetic susceptibility to tuberculosis in human population / R. Bellamy // Thorax. - 1998. - V. 53. - P. 588-593.

14. Dorman S.E. Interferon-g and interleukin12 pathway defects and human disease / S.E. Dorman, S.M. Holland // Cytokine and Growth Factors Reviews. – 2000. - №11. – P. 321-333.

15. Genetic polymorphism of IL-12 p40 gene in immunemediated disease / M.A Hall [et al.] // Genes Immunity. – 2000. - V.1. - P. 219-224.

16. Genetic susceptibility to tuberculosis in Africans:A genome-wide scan / R. Bellamy [et al.] // PNAS. – 2000. – V. 97. P. 8005–8009.

17. Host genetics of mycobacterial diseases and men: forward genetic studies of BCG-osis and tuberculosis / A. Fortin [et al.] // Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. – 2007. – N.8. – P. 163-192.

18. Hunter C.A. Cytokine and T-cell in host defense / C.A. Hunter, S.L. Reiner // Current Opinion in Immunology. - 2000. - № 12. - P. 413-418.

19. Influence of non-MHC genes on lymphocyte response to Mycobacterium tuberculosis antigens & tuberculin reactive status in pulmonary tuberculosis / P. Selvaraj [et al.] // Indian J Med Res. – 2000. – V. 112. – P. 86-92.

20. Influence of polymorphism in the genes for the interleukin (IL)-1 receptor antagonist and IL-1β on tuberculosis / R.J. Wilkinson [et al.] // J. Exp. Med. – 1999. – V. 189. - № 12. – P. 1863-1873.

21. Messenger RNA Expression of IL8, FOXP3, and IL-12B Differentiates Latent Tuberculosis Infection from Disease1 / B. Wu [et al.] // The J. of Immunology. – 2007. – V. 178. – P. 3688–3694.

22. Möller M. Past, present and future directions in human genetic susceptibility to tuberculosis / M. Möller, E. de Wit, E.G. Hoal // FEMS Immunol. Med. Microbiol. – 2009. – V. 2. – P. 1-24.

23. Polymorphism in human IL-1 receptor antagonist gene intron 2 is caused by variable number of an 86-bp tandem repeat / J.K. Tarlow [et al.] // Human Genetics. – 1993. – V. 91. – P. 403-404.

24. Polymorphism in IL1B: IL1B-511 association with tuberculosis and decreased lipopolysaccharide-induced IL-1ß in IFN-γ primed ex-vivo whole blood assay / A.A. Awomoyi [et al.] // J of Endotoxin Research. – 2005. - V. 11. – P. 281-286.

25. Rook G.A.W. M. tuberculosis: immunology and vaccination / G.A.W. Rook, G. Seah, A. Ustianowski // Eur. Respir. J. – 2001. – V.17. – P. 537-557.

26. Sokal R.R. Biometry. / R.R. Sokal, F.J. Rohlf / N.Y.: W.H. Freeman and Co. - 1980. - 856 p.


Review

For citations:


Babushkina N.P., Rudko A.A., Freidin M.B., Kucher A.N., Puzyrev V.P., Pavlova E.S., Alexeeva E.A., Luginova E.F., Gorokhov A.V., Kravchenko A.F., Maksimova N.R. Study of genes-candidates polymorphism of susceptibility to tuberculosis in the different ethno-territorial groups of the RF. Yakut Medical Journal. 2010;(1):35-39. (In Russ.)

Views: 29


Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1813-1905 (Print)
ISSN 2312-1017 (Online)