Сравнительный анализ генотипов Mycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутия) и Иркутской области
Аннотация
Изоляты микобактерий туберкулеза, полученные от больных с впервые выявленным туберкулезом из Иркутской области и Республики Саха (Якутия) за ноябрь 2008 - май 2010 гг., протестированы на лекарственную устойчивость и генотипированы с использованием метода MIRU-12. С помощью филогенетической реконструкции определены основные эпидемические генотипы туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ). На филогенетических моделях продемонстрированы четкие региональные различия проявления первичного туберкулеза с МЛУ, требующие территориально обоснованных стратегий диагностики и лечения.
Об авторах
С. Н. Жданова
ФБГУ «Научный центр проблем семьи и репродукции человека СО РА МН»
Россия
Россия
Жданова Светлана Николаевна – к.м.н., с.н.с.
Г. И. Алексеева
ГБУ РС (Я) НПЦ «Фтизиатрия»
Россия
Россия
Алексеева Галина Ивановна – д.м.н., зав. бактериологич. лаб.
О. Б. Огарков
ФБГУ «Научный центр проблем семьи и репродукции человека СО РА МН»
Россия
Россия
Огарков Олег Борисович – к.б.н., зав. лаб.
А. Ф. Кравченко
ГБУ РС (Я) НПЦ «Фтизиатрия»
Россия
Россия
Кравченко Александр Федорович – д.м.н., директор
Е. Ю. Зоркальцева
ГБУЗ «Иркутский областной противотуберкулезный диспансер». ГОУ ДПО «Иркутская ГМА последипломного образования»
Россия
Россия
Зоркальцева Елена Юльевна – д.м.н., зав. кафедрой
М. К. Винокурова
ГБУ РС (Я) НПЦ «Фтизиатрия»
Россия
Россия
Винокурова Мария Константиновна – д.м.н., зам. директора по науке
Е. Д. Савилов
ГБУЗ «Иркутский областной противотуберкулезный диспансер». ГОУ ДПО «Иркутская ГМА последипломного образования»
Россия
Россия
Савилов Евгений Дмитриевич – д.м.н., проф., зав. кафедрой
Список литературы
1. Молекулярное типирование штаммов микобактерий туберкулеза в Иркутской области (Восточная Сибирь) в 2000-2005 гг. / О.Б. Огарков, Т.В. Медведева, Т. Zozio [и др.] //Молекулярная медицина. – 2007. - №2. – С. 33-38.
2. Характеристика лекарственно устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis с помощью молекулярно-генетических методов / С.Н. Жданова, Е.Ю. Зоркальцева, О.Б. Огарков, О.А. Воробьева [и др.] //Сибирский медицинский журнал (Иркутск). – 2011. - №6. – С. 228-230.
3. Эпидемиологический анализ: Методы статистической обработки материала / Е.Д. Cавилов, В.А. Астафьев, С.Н. Жданова, Е.А. Заруднев. – Новосибирск: Наука-Центр, 2011. – 156с.
4. A publicly available international multimarker database for studying Mycobacterium tuberculosis genetic diversity and molecular epidemiology / C. Demay, B. Liens, T. Burguière, V. Hill [et al.] // SITVITWEB. Infect Genet Evol. - 2012. - 12(4). - P. 755-66.
5. Automated high-throughput genotyping for study of global epidemiology of Mycobacterium tuberculosis based on mycobacterial interspersed repetitive units / Supply P., Lesjean S., Savine E. [et al.] // J Clin Microbiol. - 2001. - 39(10). - P. 3563-71.
6. Central Research Institute of Health Organization and Information. Key indicators of tuberculosis in Russia in 2009. Accessed at http://tbpolicy.ru/statistic/national/ April, 2012.World Health Organization. Global tuberculosis control report. World Health Organization, Geneva, Switzerland, 2011.
7. Characterization of drug-resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis derived from Russian inmates / I.G. Shemyakin, V.N. Stepanshina, I.Y. Stepanshina [et al.] // Int J Tuberc Lung Dis. - 2004. - 8(10). - P. 1194–1203.
8. Dispersal of Mycobacterium tuberculosis via the Canadian fur trade / C.S. Pepperell, J.M. Granka, D.C. Alexander [et al.] // Proc Nat Acad Sci. - 2011. - 108(16). P. 6526–6531.
9. Hamers F.F., Downs A.M. HIV in central and eastern Europe / F.F. Hamers, A.M. Downs // Lancet 2003; 361: 1035–44.
10. Highest prevalence of Mycobacterium Beijing genotype isolates in patients newly diagnosed with tuberculosis in the Novosibirsk oblast, Russian Federation / M.A. Dymova, V.N. Kinsht, A.G. Cherednichenko [et al.] // J Med Microbiol. - 2011. - 60. - P. 1003-09.
11. Irkutsk Oblast Center for AIDS and Infectious Diseases Prevention and Control. Accessed from Russian Red Cross 2011 report, http://www.redcross-irkutsk.org/en/news. June, 2012.
12. Major Mycobacterium tuberculosis lineages associate with patient country of origin / M.B. Reed, V.K. Pichler, F. McIntosh [et al.] // J Clin Microbiol. - 2009. - 47(4). - P. 1119-28.
13. Mokrousov I. Genetic geography of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a multifacet mirror of human history? / I. Mokrousov // Infect Genet Evol. - 2008. - 8 (6). - P. 777–785.
14. Molecular characterization of multiple drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from northwestern Russia and analysis of rifampin resistance using RNA/RNA mismatch analysis as compared to line probe assay and sequencing of rpoB gene. / I.Mokrousov, I. Filliol, E.Legrand [et al.] // Res Microbiol. - 2002. - 153. - P. 213-219.
15. Molecular typing of Mycobacterium tuberculosis circulated in Moscow, Russian Federation / M.V. Afanas’ev, L.N. Ikryannikova, E.N. Il’na [et al.] // Eur J Clin Microbiol Infect Dis. - 2011. - 30. - P. 181–191.
16. Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in Russia: in search of informative variable-number tandem-repeat loci / I.Mokrousov, O. Nrvskaya, A.Vyazovaya [et al.] // J Clin Microbiol. - 2008. - 46. - P. 3576-3584.
17. Rifampin- and multidrug-resistant tuberculosis in Russian civilians and prison inmates: dominance of the Beijing strain family / F. Drobniewski, Y. Balabanova, M. Ruddy [et al.] // Emerg Infect Dis. - 2002. - 8. - P. 1320–1326.
18. Somerville W. Extraction of Mycobacterium tuberculosis DNA: a question of containment / W. Somerville, L. Thibert, K. Schwartzman, M.A. Behr // J Clin Microbiol. - 2005. - 43. - P. 2996–2997.
19. Variable host-pathogen compatibility in Mycobacterium tuberculosis / S. Gagneux, K. DeRiemer, T. Van [et al.] // Proc Natl Acad Sci USA. - 2006. - 103. - P. 2869–2873.
20. Weniger T. MIRU-VNTRplus: a web tool for polyphasic genotyping of Mycobacterium tuberculosis complex bacteria / T. Weniger, J. Krawczyk, P. Supply, S. Niemann, D. Harmsen // Nucleic Acids Res. - 2010. - 38. Suppl: W326-331.
21. World Health Organization. Laboratory services in tuberculosis control. Part III: culture. World Health Organization, Geneva, Switzerland, 1998.
22. World Health Organization. Multidrug and extensively drug-resistant TB (M/XDR-TB): 2010 global report on surveillance and response.- World Health Organization, Geneva, Switzerland, 2010.
23. World Health Organization. Global tuberculosis control report. -World Health Organization. Geneva, Switzerland, 2011.
24. 2010 All-Russia Population Census. Federal State Statistics Service. Accessed at http://www.gks.ru/free_doc/new_site/perepis2010/perepis_itogi1612.htm. April, 2012.
Рецензия
Для цитирования:
Жданова С.Н., Алексеева Г.И., Огарков О.Б., Кравченко А.Ф., Зоркальцева Е.Ю., Винокурова М.К., Савилов Е.Д. Сравнительный анализ генотипов Mycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутия) и Иркутской области. Якутский медицинский журнал. 2013;(1):68-71.
For citation:
Zhdanova S.N., Alexeeva G.I., Ogarkov O.B., Kravchenko A.F., Zorkaltseva E.Yu., Vinokurova M.K., Savilov E.D. Comparative analysis of Mycobacterium tuberculosis genotypes in the Republic Sakha (Yakutia) and the Irkutsk region. Yakut Medical Journal. 2013;(1):68-71.
Просмотров:
2
Послать статью по эл. почте 