Межэтнические различия распределения частоты аллелей и генотипов полиморфных вариантов гена NAT2 у больных туберкулезом органов дыхания
https://doi.org/10.25789/YMJ.2019.68.05
Аннотация
Изучены межэтнические различия частоты аллелей и распределения генотипов полиморфных вариантов гена NAT2 (NAT2*5, NAT2*6, NAT2*7) среди этнических групп якутов и русских с впервые выявленным туберкулезом органов дыхания. В результате исследования впервые была установлена частота аллелей и генотипов полиморфных вариантов гена NAT2 (NAT2*5, *6, *7) среди этнических групп якутов и русских, постоянно проживающих на территории РС(Я). Определена распространённость полиморфизмов NAT2*5, *6, *7 среди якутов и русских. Выявлены межэтнические различия частоты аллелей и распределения генотипов полиморфных вариантов rs1801280 (341T>C), rs1799930 (590G>A) и rs1799931 (857G>A) гена NAT2.
Об авторах
Н. М. КрасноваРоссия
Краснова Наталия Михайловна – к.м.н., доцент МИ
А. И. Фёдоров
Россия
Фёдоров Афанасий Иванович – к.б.н., с.н.с. НИЦ, доцент МИ
О. А. Суворова
Россия
Суворова Ольга Александровна – студентка
А. Ф. Кравченко
Россия
Кравченко Александр Федорович – д.м.н., директор
Н. Е. Евдокимова
Россия
Евдокимова Надежда Евстафьевна – врач фтизиатр
Е. Н. Ефремова
Россия
Ефремова Ефросинья Николаевна – врач фтизиатр
Я. В. Чертовских
Россия
Чертовских Яна Валерьевна – гл. внештат. клинический фармаколог МЗ РС(Я), зав.
Е. А. Алексеева
Россия
Алексеева Елизавета Александровна – биолог
З. А. Рудых
Россия
Рудых Зоя Александровна – врач
О. Л. Васильева
Россия
Васильева Ольга Лукинична – врач клинический фармаколог
Д. А. Сычев
Россия
Сычев Дмитрий Алексеевич – д.м.н., проф., член-корр. РАН, проф. РАН, ректор
Список литературы
1. Вариабельность фенотипа N-ацетилтрансферазы у жителей г. Гомеля и Гомельской области / Т.В. Сатырова [и др.] // Проблемы здоровья и экологии. – 2010. – № 1 (23). – С. 73–77.
2. Казаков Р.Е. Фармакогенетика и клинические исследования: точки соприкосновения / Р.Е. Казаков, Н.Г. Бердникова, Д.А. Сычёв // Фармакогенетика и фармакогеномика. – 2016. – № 1. – С. 18–23.
3. Нежелательные побочные реакции на противотуберкулезные препараты основного ряда / Н.А. Степанова [и др.] // Туберкулез и болезни легких. – 2016. – Т. 94, № 5. – С. 42–45. doi: 10.21292/2075-1230-2016-94-5-42-45.
4. Показатели по туберкулезу в Российской Федерации 2008-2017 гг.: сайт Федерального государственного бюджетного учреждения Центральный научно-исследовательский институт организации и информатизации здравоохранения МЗиСР РФ. [Электронный ресурс]. – Режим доступа: URL: http://old.mednet.ru/ru/czentr-monitoringa-tuberkuleza.html (дата обращения 08.06.2019г).
5. Arylamine N-Acetyltransferase 2 (NAT2) Genetic Diversity and Traditional Subsistence: A Worldwide Population Survey / A. Sabbagh [et al.] // PLoS One. – 2011. – Vol.4, № 6. Available from:https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0018507 (accessed 20 June 2019). doi.org/10.1371/journal.pone.0018507.
6. Association and clinical utility of NAT2 in the prediction of isoniazid-induced liver injury in Singaporean patients / SL. Chan [et al.] // PLoS One. – 2017. – Vol. 12, № 10. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5642896/pdf/pone.0186200.pdf (accessed 20 June 2019). doi: 10.1371/journal.pone.0186200.
7. Correlation of N-Acetyltransferase 2 Genotype with Isoniazid Acetylation in Polish Tuberculosis Patients / J. Jagodziński [et al.] // Biomed Res. Int. – 2013. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24383060 (accessed 6 June 2019) doi: 10.1155/2013/853602.
8. Determining the relation between N-acetyltransferase-2 acetylator phenotype and antituberculosis drug induced hepatitis by molecular biologic tests / V. BozokCetintaş [et al.] // TuberkToraks. – 2008. – Vol. 56, № 1. – P. 81–86.
9. Genetic polymorphisms of drug-metabolizing enzymes and anti-TB drug-induced hepatitis / SH. Kim [et al.] // Pharmacogenomics. – 2009. – Vol. 10, № 11. – P. 1767–1779. doi: 10.2217/pgs.09.100.
10. Genetic structure, self-identified race/ethnicity, and confounding in case-control association studies/ H. Tang [et al.] // Am J Hum Genet. – 2005. – Vol. 76, № 2. – P. 268–275.
11. Hein D. W. N-acetyltransferase 2 genetic polymorphism : effects of carcinogen and haplotype on urinary bladder cancer risk / D. W. Hein // Oncogene. – 2006. – Vol. 25, № 11. – P.1649–1658.
12. Jarrar YB. Sequence analysis of the N-acetyltransferase 2 gene (NAT2) among Jordanian volunteers / YB Jarrar, AA Balasmeh, W Jarrar // Libyan J Med. – 2018 – Vol. 13, № 1. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5717714/–1408381 (accessed 1 June 2019). doi: 10.1080/19932820.2017.1408381.
13. Kurose K. Population differences in major functional polymorphisms of pharmacokinetics / pharmacodynamics-related genes in Eastern Asians and Europeans: implications in the clinical trials for novel drug development / K. Kurose, E. Sugiyama, Y. Saito // Drug MetabPharmacokinet. – 2012. – Vol. 27, №1. – P. 9–54.
14. Low N-acetyltransferase 2 activity in isoniazid-associated acute hepatitis requiring liver transplantation / JP. Cramer [et al.] // Transpl Int. – 2010. – Vol. 23, № 2. – P. 231–233. doi: 10.1111/j.1432-2277.2009.00921.x.
15. Ma Q. Pharmacogenetics, pharmacogenomics, and individualized medicine / Q Ma, A.Y. Lu // Pharmacol Rev. – 2011. – Vol. 63, № 2. – P. 437–459. doi: 10.1124/pr.110.003533
16. Microarray-based detection of CYP1A1, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, GSTT1, GSTM1,MTHFR,MTRR, NQO1,NAT2, HLADQA-1,and AB0 allele frequencies in native Russians / O. Gra [et al.] // Genet Test Mol Biomarkers. – 2010. – Vol. 14, № 3. – P. 329–342. doi: 10.1089/gtmb.2009.0158.
17. NAT2 and CYP2E1 polymorphisms associated with antituberculosis drug-induced hepatotoxicity in Chinese patients / HR. An [et al.] // Clin Exp Pharmacol Physiol. – 2012. – Vol. 39, № 6. – P. 535–543. doi: 10.1111/j.1440-1681.2012.05713.x.
18. NAT2 Gene Polymorphisms in Turkish Patients with Psoriasis Vulgaris / R. Dursun [et al.] //Biomed Res Int. – 2018. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=NAT2+Gene+Polymorphisms+in+Turkish+Patients+with+Psoriasis+Vulgaris (accessed 15 June 2019) doi: 10.1155/2018/3258708.
19. Pharmacogenomics Knowledge for Personalized Medicine / Whirl-Carrillo [et al.] // Clinical Pharmacology & Therapeutics. – 2012. – Vol. 92, № 4. – P. 414–417. doi: 10.1038/clpt.2012.96
20. PharmGKB Summary: Isoniazid Pathway, Pharmacokinetics / Daniel J. Klein [et al.] // Pharmacogenet Genomics. – 2016. – Vol. 26, № 9. – P. 436–444. doi: 10.1097/FPC.0000000000000232
21. Polymorphism of the N-acetyltransferase 2 gene as a susceptibility risk factor for antituberculosis drug-induced hepatotoxicity in Tunisian patients with tuberculosis / L Ben Mahmoud [et al.] // PatholBiol (Paris). – 2012. – Vol. 60, № 5. – P. 324–330. doi: 10.1016/j.patbio.2011.07.001.
22. The Pharmacogenetics of NAT2 Enzyme Maturation in Perinatally HIV Exposed Infants Receiving Isoniazid / R. Zhu [et al.] // J Clin Pharmacol. – 2009. – Vol. 6, №11. – P. 1249–1254.
23. Tuberculosis Pharmacogenetics: State of The Art (March 20th 2013) / Raquel Lima de Figueiredo Teixeira [et al.] // Tuberculosis - Current Issues in Diagnosis and Management Available from: https://www.intechopen.com/books/tuberculosis-current-issues-in-diagnosis-and-management/tuberculosis-pharmacogenetics-state-of-the-art (accessed 5 June 2019). doi: 10.5772/54984.
Рецензия
Для цитирования:
Краснова Н.М., Фёдоров А.И., Суворова О.А., Кравченко А.Ф., Евдокимова Н.Е., Ефремова Е.Н., Чертовских Я.В., Алексеева Е.А., Рудых З.А., Васильева О.Л., Сычев Д.А. Межэтнические различия распределения частоты аллелей и генотипов полиморфных вариантов гена NAT2 у больных туберкулезом органов дыхания. Якутский медицинский журнал. 2019;(4):22-25. https://doi.org/10.25789/YMJ.2019.68.05
For citation:
Krasnova N.M., Fedorov A.I., Suvorova O.A., Kravchenko A.F., Evdokimova N.E., Efremova E.N., Hertovskykh Ya.V., Alekseeva E.A., Rudykh Z.A., Vasilieva O.L., Sychev D.A. Ethnic differences in distributions of allelic and genotypic frequencies of NAT2 polymorphic variants in patients with pulmonary tuberculosis. Yakut Medical Journal. 2019;(4):22-25. https://doi.org/10.25789/YMJ.2019.68.05