Полиморфизм G-308A гена TNF-α у бурят
Аннотация
В настоящем исследовании определены частоты аллелей полиморфизма G-308A гена TNF у бурят по результатам изучения 16 субпопуляций из 5 районов Республики Бурятия (N=865). Показано, что частота аллеля А изучаемого полиморфизма у бурят составляет 11,5%. При сравнении с другими сибирскими популяциями найдены статистически значимые отличия от якутов. В нескольких субпопуляциях выявлено отклонение частот генотипов от закона Харди-Вайнберга. Расчет коэффициентов генной дифференциации для всех населенных пунктов (Gst=0,0167) и для 5 изучаемых районов (Gst=0,0053) показал, что значительной дифференциации генофонда бурят по данному полиморфизму не наблюдается. Полученные результаты дают характеристику распространенности у бурят функционально значимого полиморфизма, для которого известны ассоциации с различными мультифакториальными заболеваниями.
Об авторах
Г. О. Дугарова
Детская республиканская клиническая больница
Россия
Россия
Дугарова Галина Октябрьевна – зав. МГК
г. Улан-Удэ
М. В. Голубенко
НИИ медицинской генетики СО РАМН
Россия
Россия
Голубенко Мария Владимировна – к.б.н., с.н.с.
г. Томск
Е. Р. Еремина
Бурятский филиал НИИ МГ СО РАМН
Россия
Россия
Еремина Елена Робертовна – к.м.н., директор
г.Улан-Удэ
Л. И. Минайчева
НИИ МГ СО РАМН
Россия
Россия
Минайчева Лариса Ивановна – к.м.н., н.с.
г. Томск
С. В. Фадюшина
НИИ МГ СО РАМН
Россия
Россия
Фадюшина Светлана Валерьевна – м.н.с.
Список литературы
1. Вейр Б. Анализ генетических данных / Б. Вейр. - М.: Мир, 1995. 400с.
2. Лакин Г.Ф. Биометрия: Учеб. пособие для биол. спец. вузов / Г.Ф. Лакин. – М.: Высшая школа., 1990. – 352 с.
3. Эпидемиологическое изучение наследственных заболеваний у сельского населения Республики Бурятия / Л.И. Минайчева [и др.] // Вестник Бурятского государственного университета. - Улан-Удэ, 2007. С. 14-16.
4. Нимаев Д.Д. Буряты: этногенез и этническая история / Д.Д. Нимаев. – Улан-Удэ: Издательско-полиграфический комплекс ВСГАКИ, 2000. – 190с.
5. Пузырев В.П. Генетическое разнообразие народонаселения и болезни человека / В.П. Пузырев, М.Б. Фрейдин, А.Н. Кучер. – Томск: Изд-во «Печатная мануфактура», 2007. – 320 с.
6. Bazzoni F. The tumor necrosis factor ligand and receptor families / F. Bazzoni, B. Beutler // N Engl.J.Med. 1996. V. 334. P. 1717 -1725.
7. Secretion of tumor necrosis factor alpha and lymphotoxin alpha in relation topolymorpHisms in the inflammatorybowel disease / Bouma G. [et al.]//Scand. J. Immunol. 1996. V. 43(4). P. 456- 463.
8. Gupta V. [et al.] Association of G-308A TNFalpha polymorpHism with bronchial asthma in a North Indian population / V. Gupta [et al.] // J Asthma. - 2005. V. 12. P. 839 – 841.
9. PolymorpHisms of the tumor necrosis factor alpha and interleukin-10 genes in Japanese patients with idiopathic dilated cardiomyopathy / Ito M. [et al.] // Jpn. Heart J. 2000.V.41.P. 183 -191.
10. Johns M. Purification of human genomic DNA from whole blood using sodium perchlorate in place of phenol / M. Johns, J. Paulus-Thomas // Anal.Biochem. 1989. V. 180. № 2. P. 276-278.
11. Keatings V.M. A PolymorpHism in the tumor necrosis factor-α gene promoter region may predispose to a poor prognosis in COPD / V.M. Keatings [et al.] // Chest. - 2000.V. 118.P. 971-975.
12. Mangia A. ILl-10 haplotypes as possible predictors of spontaneous clearance of HCV infection / A. Mangia [et al.] // cytokine. - 2004. V. 3.P. 103-109.
13. Nedwin G. E. Human lymphotoxin and tumor necrosis factor genes: structure, homology and chromosomal localization / G. E. Nedwin [et al.] // Nucleic Acids Res. - 1985. V.13. P 6361 – 6373.
14. Nei M. Molecular population genetics and evolution / M. Nei. - Amsterdam: North Holland publishing company; New York: Oxford American Elsevier publishing company, 1975. 288 p.
15. Ramasawmy R. Association of polymorpHisms within the promoter region of the tumor necrosis factor-alpha with clinical outcomes of rheumatic fever / R. Ramasawmy [et al.] // J. Mol Immunol. - 2007. V. 44. P. 1873-1878.
16. Rosmond R. G-308A PolymorpHism of the tumor necrosis factor alpha gene promoter and salivary cortical secretion / R. Rosmond [et al.] // J. Clin. Endocrinol. Metab. 2001. V. 86.P.2178-2180.
17. Shiau M.Y. [et al.] Cytokine promoter polymorpHisms in Taiwanese patients with Graves’ disease / M.Y. Shiau [et al.] // J.Clin Biochem. 2007. V. 40. P. 213-217.
18. Wilson A.G. Single base polymorpHism in the human tumor necrosis factor alpha (TNF-α) gene detectable by NcoI restriction of PCR product / A.G. Wilson [et al.] // Hum. Mol. Genet. - 1992. - V.1. - P.400 c.
Рецензия
Для цитирования:
Дугарова Г.О., Голубенко М.В., Еремина Е.Р., Минайчева Л.И., Фадюшина С.В. Полиморфизм G-308A гена TNF-α у бурят. Якутский медицинский журнал. 2009;(2):127-129.
For citation:
Dugarova G.O., Golubenko M.V., Eremina E.R., Minajcheva L.I., Fadjushina S.V. G-308A polymorphism in the tumor necrosis factor-alpha gene in Buryats. Yakut Medical Journal. 2009;(2):127-129. (In Russ.)
Просмотров:
2
Послать статью по эл. почте 