Разработка структуры базы данных для биобанков Организация здравоохранения, медицинской науки и образования
Аннотация
Сбор, первичная обработка и последующее использование биологического материала порождают множество проблем организационного характера, которые с успехом решаются с применением биобанков. Одной из основных составляющих успешной работы биобанков является практичность, функциональность и надежность базы данных для хранения сопроводительной информации. В статье рассмотрены основные принципы и проблемы разработки баз данных для биоколлекционных ресурсов на примере Биобанка НИИ медицинской генетики СО РАМН.
При поддержке: Работа выполнена в рамках реализации ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009 – 2013 годы (гос. контракт №П722).
Об авторах
С. В. Буйкин
НИИ медицинской генетики СО РАМН
Россия
Россия
Буйкин Степан Вячеславович – н.с.
г. Томск
Е. Ю. Брагина
НИИ медицинской генетики СО РАМН
Россия
Россия
Брагина Елена Юрьевна – н.с.
г. Томск
Л. А. Конева
НИИ медицинской генетики СО РАМН
Россия
Россия
Конева Лада Анатольевна – н.с.
г. Томск
Список литературы
1. Брагина Е.Ю. Влияние численности контрольной выборки на значимость ассоциаций генетических маркеров с развитием мультифакториальных заболеваний / Е.Ю. Брагина, С.В. Буйкин // Якутский медицинский журнал. – 2009. – №2(26). – Стр. 142-144.
2. Брагина Е.Ю. Биологические банки: проблемы и перспективы их использования в исследованиях генетических аспектов комплексных заболеваний человека / Е.Ю. Брагина, С.В. Буйкин, В.П. Пузырев // Медицинская генетика. – 2009. – №3. – С. 20-27.
3. Игнасимуту С. Основы биоинформатики / С. Игнасимуту. – М., 2007 – Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», Институт компьютерных исследований. – 320 с.
4. Введение в базы данных: учебное пособие / И.П. Карпова. – М: Издательство МГИЭМ, 2005. – 96 C.
5. Кузнецов С.Д. Основы современных баз данных, информационно-аналитические материалы / С.Д. Кузнецов // http://citforum.ru/database/osbd/contents.shtml. -- 2008.
6. Федеральный закон от 27.07.2006 N 152-ФЗ (ред. от 27.12.2009) “О персональных данных” // Российская газета. – 2006. – № 165.
7. Feero W.G., Guttmacher A.E. Genomewide Association Studies and assessment of the risk of disease // N Engl J Med. – 2010. – V. 363. – P. 166 -176.
8. Frazier L., Sparks E., Sanner J.E. Biobanks and biomarker research in cardiovascular disease // J Cardiovasc Nurs. – 2008. – V. 23(2). – P. 153-158.
9. Gottweis H., Zatloukal K. Biobank governance: trends and perspectives // Pathobiology. – 2007. – V.74(4). – P. 206-211.
10. Little J., Higgins J.P.T., Ioannidis J.P.A. Strengthening the reporting of genetic association studies (STREGA): an extension of the STROBE Statement // Hum.Genet. – 2009. – V. 125. – P. 131-151.
11. Shickle D. The consent problem within DNA biobanks // Stud Hist Philos Biol Biomed Sci. – 2006. – V.37(3). – P. 503-519.
12. Swede H., Stone C.L., Norwood A.R. National population-based biobanks for genetic research // Genetics in Medicine. – 2007. – V.9(3). – P. 141-149.
13. The Wellcome trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14000 cases of seven common diseases and 3000 shared controls // Nature. - 2007. – V. 447. – P. 661-678.
Рецензия
Для цитирования:
Буйкин С.В., Брагина Е.Ю., Конева Л.А. Разработка структуры базы данных для биобанков Организация здравоохранения, медицинской науки и образования. Якутский медицинский журнал. 2011;(1):71-73.
For citation:
Bujkin S.V., Bragina E.J., Koneva L.A. S.V., E.J., L.A. Working out of database structure for biobanks. Yakut Medical Journal. 2011;(1):71-73.
Просмотров:
0
Послать статью по эл. почте 