Вариация числа копий ДНК (14 онкоассоциированных генов) при немелкоклеточном раке легкого
https://doi.org/10.25789/YMJ.2022.79.03
Аннотация
Целью работы было изучение относительной копийности 14 онкоассоциированных генов (APC, AURCA, CCND1, GKN1, PIK3CA, NKX21, ERBB2, SOX2, EGFR1, BRCA1, BRCA2, TP63, CDKN2A, MDM2) в образцах опухолевой ткани легкого как потенциальных онкомаркеров рака легкого. Статистически значимые события изменения CNV (р<0,05) были зафиксированы нами для генов CCND1, GKN1, PIK3CA, EGFR1, SOX2, BRCA2, TP63, MDM2 в образцах плоскоклеточного рака и NKX2-1 в образцах аденокарциномы легкого. Таким образом, эти гены могут быть использованы в качестве дифференцирующих и диагностических биомаркеров при НМРЛ.
Об авторах
Р. Д. Аль-Нсоур
Медицинская академия им. С.И. Георгиевского ФГАОУ ВО «КФУ им. В.И. Вернадского»
Россия
Россия
Аль-Нсоур Рашед Д. – аспирант кафедры онкологии
Н. А. Петрусенко
ФГБУ «НМИЦ онкологии» МЗ РФ
Россия
Россия
Петрусенко Наталья Александровна – м.н.с.
Ростов-на-Дону
В. В. Олексеенко
Медицинская академия им. С.И. Георгиевского ФГАОУ ВО «КФУ им. В.И. Вернадского»
Россия
Россия
Олексеенко Виктор Валентинович – д.м.н., доцент, зав. кафедрой
А. Ю. Максимов
ФГБУ «НМИЦ онкологии» МЗ РФ
Россия
Россия
Максимов Алексей Юрьевич – д.м.н., проф., зам. ген. директора
Ростов-на-Дону
О. Н. Статешный
ФГБУ «НМИЦ онкологии» МЗ РФ
Россия
Россия
Статешный Олег Николаевич – врач-онколог
Ростов-на-Дону
Список литературы
1. Биомаркеры для иммунотерапии немелкоклеточного рака легкого / Харагезов Д.А., Лазутин Ю.Н., Златник Е.Ю. [и др.] // Южно-Российский онкологич. журнал. - 2021;2(3):31-41 https://doi.org/10.37748/2686-9039-2021-2-3-4
2. Петрусенко Н.А. Мутации в генах BRCA1/2 у пациенток юга России с злокачественными новообразованиями яичников/ Петрусенко Н.А., Вереникина Е.В., Якубова Д.Ю., Тимошкина Н.Н. // Якутский медицинский журнал. – 2020. - №4(72), с.87-89. DOI 10.25789/YMJ.2020.72.21.
3. Петрусенко Н.А. Изменение копийности генов в злокачественных опухолях шейки матки с эндофитной и экзофитной формами роста / Петрусенко Н.А., Никитина В.П., Спиридонова Д.А., Кечерюкова М.М. // Современные проблемы науки и образования. – 2019. – № 3.; URL: http://www.science-education.ru/ru/articleview?id=28981 (date of access: 04/26/2021).
4. Duruisseaux M, Esteller M. Lung cancer epigenetics: From knowledge to applications. Semin Cancer Biol. 2018 Aug;51:116-128. doi: 10.1016/j.semcancer.2017.09.005.
5. Erdem J.S., Skuag V., Bakke P., Gulsvik A., Haugen A., Zienolddiny S. Mutations in TP53 increase the risk of SOX2 copy number alterations and silencing of TP53 reduces SOX2 expression in non-small cell lung cancer. BMC Cancer. 2016;16:28. https://doi.org/10.1186/s12885-016-2061-3 .
6. Fukazawa T., Guo M., Ishida N., Yamatsuji T., Takaoka M., Yokota E., Haisa M., Miyake N., Ikeda T., Okui T., et al. SOX2 suppresses CDKN1A to sustain growth of lung squamous cell carcinoma. Sci. Rep. 2016;6:20113. doi: 10.1038/srep20113.
7. Gamazon E.R., Stranger B.E. The Impact of Human Copy Number Variation on Gene Expression. Brief. Funct. Genom. 2015;14:352– 357. doi: 10.1093/bfgp/elv017.
8. Hokari S, Tamura Y, Kaneda A, et al. Comparative analysis of TTF-1 binding DNA regions in small-cell lung cancer and non-small-cell lung cancer. Mol Oncol. 2020;14(2):277-293. doi:10.1002/1878-0261.12608.
9. Jabs V, Edlund K, König H, Grinberg M, Madjar K, Rahnenführer J, Ekman S, Bergkvist M, Holmberg L, Ickstadt K, Botling J, Hengstler JG, Micke P. Integrative analysis of genome-wide gene copy number changes and gene expression in non-small cell lung cancer. PLoS One. 2017 Nov 7;12(11):e0187246. doi: 10.1371/journal.pone.0187246.
10. Klein AM, de Queiroz RM, Venkatesh D, Prives C. The roles and regulation of MDM2 and MDMX: it is not just about p53. Genes Dev. 2021;35(9-10):575-601. doi:10.1101/gad.347872.120.
11. Lakshmanachetty S, Balaiya V, High WA, Koster MI. Loss of TP63 Promotes the Metastasis of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma by Activating MAPK and STAT3 Signaling. Mol Cancer Res. 2019;17(6):1279-1293. doi:10.1158/1541-7786.MCR-18-1355.
12. Li Q., Liu F., Zhang Y., Fu L., Wang C., Chen X., Guan S., Meng X. Association of SOX2 and Nestin DNA amplification and protein expression with clinical features and overall survival in non-small cell lung cancer: A systematic review and meta-analysis. Oncotarget. 2016;7:34520–34531. doi: 10.18632/oncotarget.9145.
13. Martell K, McIntyre JB, Kornaga EN, Chan AMY, Phan T, Köbel M, Enwere EK, Dean ML, Ghatage P, Lees-Miller SP, Doll CM. PIK3CA mutation and CNV status and post-chemoradiotherapy survival in patients with cervical cancer. Gynecol Oncol. 2020 Sep;158(3):776- 784. doi: 10.1016/j.ygyno.2020.06.506.
14. Potempa M., Jonczyk P., Zalewska-Ziob M. Molekularne uwarunkowania raka płuca. Onkol. Prak. Klin. 2014;10:199–211.
15. Rooney M., Devarakonda S., Govindan R. Genomics of squamous cell lung cancer. Oncologist. 2013;18:707–716. doi: 10.1634/theoncologist.2013-0063.
16. Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Cancer statistics, 2020. CA Cancer J Clin 2020; 70: 7–30.
17. Turnbull C, Sud A, Houlston RS. Cancer genetics, precision prevention and a call to action. Nat. Genet. 2018;50:1212–1218. doi: 10.1038/s41588-018-0202-0.
18. Wei XW, Gao X, Zhang XC, Yang JJ, Chen ZH, Wu YL, Zhou Q. Mutational landscape and characteristics of ERBB2 in non-small cell lung cancer. Thorac Cancer. 2020;11(6):1512- 1521. doi:10.1111/1759-7714.13419.
19. Yang Y, Lu T, Li Z, Lu S. FGFR1 regulates proliferation and metastasis by targeting CCND1 in FGFR1 amplified lung cancer. Cell Adh Migr. 2020;14(1):82-95. doi:10.1080/19336918.2020.1766308.
20. Zappa C, Mousa SA. Non-small cell lung cancer: current treatment and future advances. Transl Lung Cancer Res. 2016 Jun;5(3):288- 300. doi: 10.21037/tlcr.2016.06.07.
Рецензия
Для цитирования:
Аль-Нсоур Р.Д., Петрусенко Н.А., Олексеенко В.В., Максимов А.Ю., Статешный О.Н. Вариация числа копий ДНК (14 онкоассоциированных генов) при немелкоклеточном раке легкого. Якутский медицинский журнал. 2022;(3):11-16. https://doi.org/10.25789/YMJ.2022.79.03
For citation:
Al-Nsour R.D., Petrusenko N.A., Olekseenko V.V., Maksimov A.Y., Stateshn O.N. DNA copy number variations (14 cancer-associated genes) in non-small cell lung cancer. Yakut Medical Journal. 2022;(3):11-16. https://doi.org/10.25789/YMJ.2022.79.03
Просмотров:
15
Послать статью по эл. почте 