Диагностика геномной патологии в группе детей с умственной отсталостью и аутизмом с помощью SNP-олигонуклеотидного молекулярного кариотипирования

Для оценки диагностического потенциала SNP-олигонуклеотидного молекулярного кариотипирования (наиболее эффективного метода молекулярно-цитогенетической детекции геномных вариаций) проведено исследование генома 100 детей с умственной отсталостью и/ или аутизмом. Были обнаружены 8 численных и структурных хромосомных аномалий (размер: более 5 млн. пн) и 20 субмикроскопических геномных перестроек (размер: 0,5-3 млн. пн). В девяти случаях были обнаружены генные мутации в виде экзонных делеций и дупликаций, связанных с фенотипическими проявлениями. В результате был сделан вывод о том, что эффективность использованной технологии составляет не менее 37%. Помимо этого, дальнейшие исследования с помощью оригинальной биоинформатической технологии позволили в 55 случаях определить патогенетические процессы, связанные с вышеуказанными изменениями психики. Таким образом, сочетание SNP-олигонуклеотидного молекулярного кариотипирования и биоинформатических методов обладает высокой эффективностью для выявления геномной патологии и определения молекулярных механизмов нарушения психики в группе детей с умственной отсталостью и аутизмом.

1. Гетерохроматиновые районы хромосом человека: медико-биологические аспекты / С.Г. Ворсанова, И.Ю. Юров, И.В. Соловьев, Ю.Б. Юров. – М., 2008. – 300 с.

2. Юров И.Ю. Геномные и хромосомные болезни центральной нервной системы: молекулярные и цитогенетические аспекты / И.Ю. Юров, С.Г. Ворсанова, Ю.Б. Юров. – М., 2014. – 384 с.

3. Beaudet A.L. The utility of chromosomal microarray analysis in developmental and behavioral pediatrics / A.L. Beaudet // Child Dev. – 2013. – Vol.84, №1. – P. 121 - 132. 4.

4. Iourov I.Y. Molecular cytogenetics and cytogenomics of brain diseases / I.Y. Iourov, S.G. Vorsanova, Y.B. Yurov // Curr. Genomics. – 2008. – Vol. 9, №7. – P. 452 - 465.

5. Molecular karyotyping by array CGH in a Russian cohort of children with intellectual disability, autism, epilepsy and congenital anomalies / I.Y. Iourov, S.G. Vorsanova, O.S. Kurinnaia [et al.] // Mol. Cytogenet. – 2013. – Vol. 6. – 38.

6. Increased chromosome instability dramatically disrupts neural genome integrity and mediates cerebellar degeneration in the ataxiatelangiectasia brain / I.Y. Iourov, S.G. Vorsanova, T. Liehr [et al.]. // Hum. Mol. Genet. – 2009. – Vol. 18, №14. – P. 2656 - 2669.

7. Consensus statement: chromosomal microarray is a first-tier clinical diagnostic test for individuals with developmental disabilities or congenital anomalies / D.T. Miller, M.P. Adam, S. Aradhya [et al.] // Am. J. Hum. Genet. – 2010. – Vol. 86, №5. – P. 749 - 764.

8. The genetic landscape of autism spectrum disorders / R.O. Rosti, A.A. Sadek, K.K. Vaux, J.G. Gleeson // Dev. Med. Child. Neurol. – 2014. – Vol. 56, №1. – P. 12 - 18.

9. Array CGH in patients with developmental delay or intellectual disability: are there phenotypic clues to pathogenic copy number variants? / M. Shoukier, N. Klein, B. Auber [et al.] // Clin. Genet. – 2013. – Vol. 83, №1. – P. 53 - 65.

10. Unexplained autism is frequently associated with low-level mosaic aneuploidy / Y.B. Yurov, S.G. Vorsanova, I.Y. Iourov [et al.] // J. Med. Genet. – 2007. – Vol. 44, №8. – P. 521 - 525.