ymjЯкутский медицинский журналYakut Medical Journal1813-19052312-1017ЯНЦ КМП10.25789/YMJ.2021.74.19ymj-582Research ArticleАКТУАЛЬНАЯ ТЕМАACTUAL TOPICСравнительный анализ биологических свойств основных семейств генотипов M.tuberculosis у впервые выявленных больных туберкулезом органов дыханияComparative analysis of biological properties of the main families of M. tuberculosis genotypes in newly diagnosed patients with respiratory tuberculosisПавловН. Г.PavlovN. G.

Павлов Николай Герасимович – к.в.н., с.н.с.

Pavlov Nikolay G. – Cand.Sci.(Veterinary Medicine), senior researcher, Bacteriologic laboratory

png_74@mail.ruАлексееваГ. И.AlekseevaG. I.

Алексеева Галина Ивановна – д.м.н., зав. бактериологич. лаб.

Alekseeva Galina I. – Dr.Sci.(Medicine), Head of Bacteriologic laboratory

agi_nik@mail.ruВинокуроваМ. К.VinokurovaM. K.

Винокурова Мария Константиновна – д.м.н., зам. директора по организацион. и науч. Работе

Vinokurova Mariya K.– Dr.Sci.(Medicine), Deputy director for organization and science

mkvin61@mail.ruЧерныхМ. В.ChernykhM. V.

Черных Марина Валерьевна – врач-бактериолог

Chernykh Marina V. – bacteriologist, Bacteriologic laboratory

maviche@bk.ruЯковлеваМ. В.YakovlevaM. V.

Яковлева Мария Васильевна – биолог

Yakovleva Maria V. – biologist, Bacteriologic laboratory

baklaboratoriya@inbox.ruИвановаЕ. И.IvanovaE. I.

Иванова Елена Ивановна – врач-бактериолог

Ivanova Elena I. – bacteriologist, Bacteriologic laboratory

Lena-ivan@mail.ruГБУ РС(Я) НПЦ «Фтизиатрия»РоссияResearch-Practice Center ‘Phthisiatry’Russian Federation202110052025027681Copyright © Павлов Н.Г., Алексеева Г.И., Винокурова М.К., Черных М.В., Яковлева М.В., Иванова Е.И., 20252025Павлов Н.Г., Алексеева Г.И., Винокурова М.К., Черных М.В., Яковлева М.В., Иванова Е.И.Pavlov N.G., Alekseeva G.I., Vinokurova M.K., Chernykh M.V., Yakovleva M.V., Ivanova E.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://ymj.elpub.ru/jour/article/view/582

Использование современных молекулярно-генетических методов идентификации изолятов M.tuberculosis позволило получить подробную характеристику популяции возбудителя, циркулирующей на одной из малоизученных северных территорий России. Исследуемые изоляты популяции M. tuberculosis, циркулирующей на территории Республики Саха (Якутия), можно представить девятью основными неоднородными кластерами – Beijing, T, S, Ural, Lam, Haarlem, Orphan, Uganda, Х. Проведенный анализ массивности и скорости роста, лекарственной устойчивости к ПТП основных семейств генотипов возбудителя туберкулеза у впервые выявленных больных туберкулезом органов дыхания показал неоднородность биологических свойств M. tuberculosis. Наблюдается связь жизнеспособности возбудителя с проявлением первичной лекарственной устойчивости популяции M. tuberculosis, что отчетливо прослеживается в генотипе семейства S. Следовательно, массивность роста микобактерий туберкулеза свидетельствует об эпидемиологической опасности больных, выделяющих данные штаммы, особенно если она сочетается с быстрым ростом и множественной лекарственной устойчивостью.

The use of modern molecular genetic methods for the identification of M. tuberculosis isolates made it possible to obtain a detailed characterization of the pathogen population circulating in one of the poorly studied northern territories of Russia. The studied isolates of the M. tuberculosis population circulating in the Republic of Sakha (Yakutia) can be represented by nine main heterogeneous clusters - Beijing, T, S, Ural, Lam, Haarlem, Orphan, Uganda, X. The analysis of the massiveness and growth rate, drug resistance to anti-TB drugs of the main families of tuberculosis pathogen genotypes in newly diagnosed patients with respiratory tuberculosis showed the heterogeneity of the biological properties of M. tuberculosis. There is a connection between the viability of the pathogen and the manifestation of primary drug resistance of the M. tuberculosis population, which is clearly seen in the genotype S. Consequently, the massive growth of mycobacterium tuberculosis indicates the epidemiological danger of patients isolating these strains, especially if it is combined with rapid growth and multidrug resistance.

микобактерия туберкулезагенотипы микобактерий туберкулезабиологические свойства микобактериймолекулярно-генетические методыmycobacterium tuberculosisgenotypes of mycobacterium tuberculosisbiological properties of mycobacteriamolecular genetic methodsReferencesБорисов С.Е. Комментарий к статье Филинюк О.В., Яновой Г.В., Стрелиса А.К. и др. Множественная лекарственная устойчивость – туберкулез легких: медико-социальные особенности и эффективность стационарного этапа лечения // Проблемы туберкулеза. – 2008. – № 8. – С. 28.Borisov S.E. Commentary to article by Filinyuk O.V., Yanova G.V., Strelis A.K., et al. Multidrug-resistant pulmonary tuberculosis: socio-medical features and effectiveness of in-patient treatment phase // Issues of Tuberculesis – 2008. – No. 8. – P. 28.Вишневский Б.И. Эпидемиологическое значение жизнеспособности и лекарственной устойчивости МБТ / Б.И. Вишневский, А.В. Васильев, Т.М. Голубева, [и др.] // 5-й Национальный конгресс по болезням органов дыхания. – М., 1995. – №1747.Vishnevskiy A.V. Epidemiological significance of the viability and drug resistance of MTB / A.V. Vishnevskiy, T.M. Vasilyev, T.M. Golubeva, [et al.] // 5th National congress on respiratory diseases. – Moscow, 1995. – No.1747.Вирулентность микобактерий туберкулеза / Б.И. Вишневский, О.В. Нарвская, С. Н. Васильева [и др.] // Проблемы туберкулеза. – 2002. – № 10. – С. 33-36.ВVirulence of M.tuberculosis / B.I. Vishnevskiy, O.V. Narvskaya, S.N. Vasilyeva, [et al.] // Issues of tuberculosis. – 2002. – No. 10. – P. 33-36.Вишневский Б.И. Основные направления работы лаборатории микробиологии туберкулеза/ Вишневский Б.И. // Туберкулез: проблемы диагностики, лечения и профилактики: тр. Всеросс. науч.-практ. конф. – СПб., 2003. – С. 34-38.Vishnevskiy B.I. Main focus areas in the work of Tuberculosis microbiology laboratory // Tuberculosis: issues in diagnostics, treatment and prevention.: proceedings of All-Russian research-practice conference. – Saint-Petersburg, 2003. – P. 34-38.Вишневский Б.И. Вирулентность Mycobacterium tuberculosis / Б.И. Вишневский, О.А. Маничева, П.К. Яблонский // Инфекция и иммунитет. – 2014. – № (4)4. – С. 319-330.Vishnevskiy B.I. Mycobacterium tuberculosis virulence / B.I. Vishnevskiy, O.A. Manicheva, P.K. Yablonskiy // Infection and immunity. – 2014. – No. (4)4. – P. 319-330.Гращенкова О.В. Совершенствование эпидемиологического анализа при туберкулезной инфекции / О.В. Гращенкова, А.В. Васильев // Проблемы туберкулеза. – 2000. – № 6. – С. 33-36.Grashchenkova O.V. Advancements in epidemiological analysis of tuberculosis infection / O.V. Grashchenkova, A.V. Vasilyev // Issues of tuberculosis. – 2000. – No. 6. – P. 33-36.Жданова С.Н. Применение делеционного анализа по RD105 для выявления генотипа Пекин Mycobacterium tuberculosis / С.Н. Жданова, О.Б. Огарков, Л.А. Степаненко, [и др.] // Бюл. Восточно-Сибирского научн. центра СО РАМН. – 2011. – № 2. – С. 194-197.Zhdanova S.N. The deletion analysis of RD105 is a useful tool in the evaluation of Beijing strains of Mycobacterium tuberculosis / S.N. Zhdanova, O.B. Ogarkov, L.A. Stepanenko, [et al.] // Bulletin of the East Siberian Scientific Center SB RAMS. – 2011. – No. 2. – P. 194-197.Корецкая Н.М. Сравнительная характеристика диссеминированного туберкулеза легких у больных, выделяющих микобактерии туберкулеза с высокой и низкой жизнеспособностью / Н.М. Корецкая, И.В. Ярыгина // Проблемы туберкулеза. – 2007. – № 2. – С. 17-20.Koretskaya N.M. Comparative characteristics of disseminated pulmonary tuberculosis in patients isolating M.tuberculosis with high and low viability / N.M. Koretskaya, I.V. Yarygina // Issues of tuberculosis. – 2007. – No. 2. – 17-20.Корецкая Н.М. Изменения биологических свойств возбудителя при инфильтративном туберкулезе легких / Н.М. Корецкая, А.А. Чушкина // Туберкулез и болезни легких. – 2010. – № 9. – С. 33-38.Koretskaya N.M. Changes in the biological properties of the pathogen in infiltrative tuberculosis // N.M. Koretskaya, A.A. Chushkina // Tuberculosis and lung diseases. – 2010. – No. 9. – P. 33-38.Лекарственная чувствительность Mycobacterium tuberculosis в сопоставлении с их жизнеспособностью, цитотоксичностью, генотипом и течением процесса у больных туберкулезом органов дыхания / О.А. Маничева, Е.Б. Ласунская, В.Ю. Журавлев, [и др.] // Проблемы туберкулеза. – 2008. – № 12. – С. 18-22.Drug sensitivity of Mycobacterium tuberculosis in relation to its viability, cytotoxicity, genotype, and clinical disease progression in patients with pulmonary tuberculosis / O.A. Manicheva, E.B. Lasunskaya, V.Y. Zhuravlev, [et al.] // Issues of Tuberculosis. – 2008. – No. 12. – P. 18-22.Методы математического анализа эпидемиологической ситуации по туберкулезу: пособие для врачей. – СПб., 1998. – 24 с.Methods of mathematical analysis of the epidemiological situation for tuberculosis: guide for physicians. – Saint-Petersburg, 1998. – 24 p.О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации: приказ МЗ РФ №109 (21.03.2003). Приложение №11 «Инструкция по унифицированным методам микробиологических исследований при выявлении, диагностике и лечении туберкулеза».On improving anti-tuberculosis measures in Russian Federation: Order of the Russian Federation Ministry of Health no.109 (21.03.2003). Appendix 11 ‘Instructions on unified techniques for microbiological tests to detect, diagnose, and treat tuberculosis’.Сапожникова Н.В. Особенности течения туберкулеза легких в зависимости от биологических свойств возбудителя: автореф. дис. …канд. мед. наук / Сапожникова Н.В. – СПб., 2003. – 24 с.Sapozhnikova N.V. Characteristics of pulmonary tuberculosis disease progression in relation to biological properties of the causative agent. Extended abstract of Cand.Sci.(Medicine) thesis. – Saint-Petersburg, 2003. – 24 p.Тырылгин М.А. Проблемы охраны здоровья населения Крайнего Севера: на примере региона Якутия / М.А. Тырылгин. – Новосибирск: Наука, 2008. – 304 с.Tyrylgin M.A. Health protection problems in the population of the Extreme North: case of Yakutia/ Tyrylgin M.A. – Novosibirsk: Nauka Publ., 2008. – 304 p.Demay, C. “SITVITWEB – a publicly available international multimarker database for studying Mycobacterium tuberculosis genetic diversity and molecular epidemiology” / C. Demay, B. Liens, T. Burguière, [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. – 2012. – Iss. 12(4). – P. 755-766. – http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_ONLINE/queryDemay, C. “SITVITWEB – a publicly available international multimarker database for studying Mycobacterium tuberculosis genetic diversity and molecular epidemiology” / C. Demay, B. Liens, T. Burguière, [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. – 2012. – Iss. 12(4). – P. 755-766. – http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_ONLINE/queryMerker, M. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage / M. Merker, C. Blin, S. Mona, N. Duforet-Frebourg, S. Lecher, E. Willery, [et al.] // Nat Genet. – 2015. – Iss. 47(3). – P. 242-249. – doi: 10.1038/ng.3195.Merker, M. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage / M. Merker, C. Blin, S. Mona, N. Duforet-Frebourg, S. Lecher, E. Willery, [et al.] // Nat Genet. – 2015. – Iss. 47(3). – P. 242-249. – doi: 10.1038/ng.3195.Ogarkov, O. Lethal combination of mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and human CD209-336G allele in Russian male population / O. Ogarkov, S. Zhdanova, E. Savilov, I. Mokrousov, V. Sinkov, S. Antipina // Infection, genetics and evolution. – 2012. – Iss. 12(4). – P. 732-736.Ogarkov, O. Lethal combination of mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and human CD209-336G allele in Russian male population / O. Ogarkov, S. Zhdanova, E. Savilov, I. Mokrousov, V. Sinkov, S. Antipina // Infection, genetics and evolution. – 2012. – Iss. 12(4). – P. 732-736.Weniger, T. MIRU-VNTRplus: a web tool for polyphasic genotyping of Mycobacterium tuberculosis complex bacteria / T. Weniger, J. Krawczyk, P. Supply, S. Niemann, D. Harmsen // Nucleic Acids Res. – 2010. – Iss. 38. – Suppl. W326-331. – http://www.miru-vntrplus.org/MIRU/miruinfo.faces;jsessionid=89112F274226E781C7B0B0D9118FDD70Weniger, T. MIRU-VNTRplus: a web tool for polyphasic genotyping of Mycobacterium tuberculosis complex bacteria / T. Weniger, J. Krawczyk, P. Supply, S. Niemann, D. Harmsen // Nucleic Acids Res. – 2010. – Iss. 38. – Suppl. W326-331. – http://www.miru-vntrplus.org/MIRU/miruinfo.faces;jsessionid=89112F274226E781C7B0B0D9118FDD70

The authors declare that there are no conflicts of interest present.