ymjЯкутский медицинский журналYakut Medical Journal1813-19052312-1017ЯНЦ КМПymj-2082Research ArticleМЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯMETHODS OF DIAGNOSIS AND TREATMENTРазработка структуры базы данных для биобанков Организация здравоохранения, медицинской науки и образованияS.V., E.J., L.A. Working out of database structure for biobanksБуйкинС. В.BujkinS. V.

Буйкин Степан Вячеславович – н.с.

г. Томск

Tomsk, 634050 fax:(3822)51‐37‐44

stepan_buikin@medgenetics.ruБрагинаЕ. Ю.BraginaE. J.

Брагина Елена Юрьевна – н.с.

г. Томск

Tomsk, 634050 fax:(3822)51‐37‐44

bragina@ssmu.ruКоневаЛ. А.KonevaL. A.

Конева Лада Анатольевна – н.с.

г. Томск

Tomsk, 634050 fax:(3822)51‐37‐44

Lada.Koneva@ssmu.ruНИИ медицинской генетики СО РАМНРоссияInstitute of Medical genetics Siberian Branch of Russian Academy of Medical SciencesRussian Federation201117102025017173Copyright © Буйкин С.В., Брагина Е.Ю., Конева Л.А., 20252025Буйкин С.В., Брагина Е.Ю., Конева Л.А.Bujkin S.V., Bragina E.J., Koneva L.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://ymj.elpub.ru/jour/article/view/2082

Сбор, первичная обработка и последующее использование биологического материала порождают множество проблем организационного характера, которые с успехом решаются с применением биобанков. Одной из основных составляющих успешной работы биобанков является практичность, функциональность и надежность базы данных для хранения сопроводительной информации. В статье рассмотрены основные принципы и проблемы разработки баз данных для биоколлекционных ресурсов на примере Биобанка НИИ медицинской генетики СО РАМН.

Collection, preprocessing and use of biological samples cause many organizational problems, which are successfully resolved with help of biobanks. Among the components of successful work of biobank is a practical, functional and reliable database for storage of information. In the paper, principals and problems of database development for biobanks are considered, taking as example the biobank of the Institute of Medical genetics SB RAMS.

биобанкбаза данныхмультифакториальные заболеваниягеныbiobankdatabasemultifactorial diseasesgenesРабота выполнена в рамках реализации ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009 – 2013 годы (гос. контракт №П722).The study is supported by Federal Target Program “Kadry” on 2009 - 2013 (The contract no. P722 from 12.08.2009).ReferencesБрагина Е.Ю. Влияние численности контрольной выборки на значимость ассоциаций генетических маркеров с развитием мультифакториальных заболеваний / Е.Ю. Брагина, С.В. Буйкин // Якутский медицинский журнал. – 2009. – №2(26). – Стр. 142-144.Bragina E.J. Influence of control sample size on significance of associations of genetic markers with development of multifactorial diseases / E.J. Bragina, S.V. Buikin // Jakut Medical Journal. – 2009. – №2 (26). – P. 142-144.Брагина Е.Ю. Биологические банки: проблемы и перспективы их использования в исследованиях генетических аспектов комплексных заболеваний человека / Е.Ю. Брагина, С.В. Буйкин, В.П. Пузырев // Медицинская генетика. – 2009. – №3. – С. 20-27.Bragina E.J. Biobanks: problems and perspectives of their use in genetic studies of human common diseases / E.J. Bragina, S.V. Buikin, V.P. Puzyrev // Medical Genetics. – 2009. – №3. – P. 20-27.Игнасимуту С. Основы биоинформатики / С. Игнасимуту. – М., 2007 – Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», Институт компьютерных исследований. – 320 с.Ingasimutu S. Principles of bioinformatics. - Izhevsk: SRC «Regular and chaotic dynamics», Institute of computer research, 2007. - 320 p.Введение в базы данных: учебное пособие / И.П. Карпова. – М: Издательство МГИЭМ, 2005. – 96 C.Introduction to databases. The manual / I.P. Karpova.- M: Publishing house MGIEM, 2005. - 96 p.Кузнецов С.Д. Основы современных баз данных, информационно-аналитические материалы / С.Д. Кузнецов // http://citforum.ru/database/osbd/contents.shtml. -- 2008.Kusnetsov S.D. Basics of modern databases, information-analytical materials / S.D. Kusnetsov // http://citforum.ru/database/osbd/contents.shtml. - 2008Федеральный закон от 27.07.2006 N 152-ФЗ (ред. от 27.12.2009) “О персональных данных” // Российская газета. – 2006. – № 165.The Federal law 7/27/2006 N 152-FZ (red. by 12/27/2009) “About personal data” // The Russian newspaper. - 2006. - №165.Feero W.G., Guttmacher A.E. Genomewide Association Studies and assessment of the risk of disease // N Engl J Med. – 2010. – V. 363. – P. 166 -176.Feero W.G., Guttmacher A.E. Genomewide Association Studies and assessment of the risk of disease // N Engl J Med. – 2010. – V. 363. – P. 166 -176.Frazier L., Sparks E., Sanner J.E. Biobanks and biomarker research in cardiovascular disease // J Cardiovasc Nurs. – 2008. – V. 23(2). – P. 153-158.Frazier L., Sparks E., Sanner J.E. Biobanks and biomarker research in cardiovascular disease // J Cardiovasc Nurs. – 2008. – V. 23(2). – P. 153-158.Gottweis H., Zatloukal K. Biobank governance: trends and perspectives // Pathobiology. – 2007. – V.74(4). – P. 206-211.Gottweis H., Zatloukal K. Biobank governance: trends and perspectives // Pathobiology. – 2007. – V.74(4). – P. 206-211.Little J., Higgins J.P.T., Ioannidis J.P.A. Strengthening the reporting of genetic association studies (STREGA): an extension of the STROBE Statement // Hum.Genet. – 2009. – V. 125. – P. 131-151.Little J., Higgins J.P.T., Ioannidis J.P.A. Strengthening the reporting of genetic association studies (STREGA): an extension of the STROBE Statement // Hum.Genet. – 2009. – V. 125. – P. 131-151.Shickle D. The consent problem within DNA biobanks // Stud Hist Philos Biol Biomed Sci. – 2006. – V.37(3). – P. 503-519.Shickle D. The consent problem within DNA biobanks // Stud Hist Philos Biol Biomed Sci. – 2006. – V.37(3). – P. 503-519.Swede H., Stone C.L., Norwood A.R. National population-based biobanks for genetic research // Genetics in Medicine. – 2007. – V.9(3). – P. 141-149.Swede H., Stone C.L., Norwood A.R. National population-based biobanks for genetic research // Genetics in Medicine. – 2007. – V.9(3). – P. 141-149.The Wellcome trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14000 cases of seven common diseases and 3000 shared controls // Nature. - 2007. – V. 447. – P. 661-678.The Wellcome trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14000 cases of seven common diseases and 3000 shared controls // Nature. - 2007. – V. 447. – P. 661-678.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.