ymjЯкутский медицинский журналYakut Medical Journal1813-19052312-1017ЯНЦ КМП10.25789/YMJ.2019.67.14ymj-1002Research ArticleМЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯMETHODS OF DIAGNOSIS AND TREATMENTДНК-диагностика в клинической практике применительно к трансляционной медицинеDNA diagnostics in clinical practice applied to translational medicineКононоваС. К.KononovaS. K.

Кононова Сардана Кононовна - к.б.н., с.н.с.

Kononova Sardana Kononova - senior researcher of the laboratory of molecular genetics

Yakutsk

konsard@rambler.ruБарашковН. А.BarashkovN. A.

Барашков Николай Алексеевич - к.б.н., в.н.с.-руковод. лаб.

Barashkov Nikolay Alekseevich -head of the laboratory of molecular genetics

Yakutsk

barashkov2004@mail.ruПшенниковаВ. Г.PshennikovaV. G.

Пшенникова Вера Геннадьевна - к.б.н., н.с.

Pshennikova Vera Gennadevna - researcher of the laboratory of molecular genetics

Yakutsk

psennikovavera@mail.ruСидороваО. Г.SidorovaO. G.

Сидорова Оксана Гарильевна - н.с.

Sidorova Oksana Gavril’evna - researcher of the laboratory of hereditary pathology

Yakutsk

okssi66@mail.ruДавыдоваТ. К.DavydovaT. K.

Давыдова Татьяна Кимовна – к.м.н., в.н.с.- руковод. лаб.

Davydova Tatyana Kimovna - PhDs in Medicine, head of the laboratory of neurodegenerative diseases

Yakutsk

tanya.davydova.56@inbox.ruСофроноваС. И.SofronovaS. I.

Софронова Саргылана Ивановна – к.м.н., гл.н.с.-руковод. отдела

Sofronova Sargylana Ivanovna, PhD, Chief Researcher

Yakutsk

sara2208@mail.ruРомановаА. Н.RomanovaA. N.

Романова Анна Николаевна – д.м.н., директор

Romanova Anna Nikolaevna, MD, the director

Yakutsk

ranik@mail.ruХуснутдиноваЭ. К.KhusnutdinovaE. K.

Хуснутдинова Эльза Камилевна – д.б.н., проф., акад. АН Республики Башкортостан, директор

Khusnutdinova Elsa Kamilevna - doctor of biological sciences, professor, academician of the Academy of Sciences of the Republic of Bashkortostan, Director of the Institute of biochemistry and genetics

Ufa

elzakh@rambler.ruФедороваС. А.FedorovaS. A.

Федорова Сардана Аркадьевна – д.б.н., зав. лаб. ИЕН

Fedorova Sardana Arkadyevna - doctor of biological sciences, head of the laboratory of molecular biology

Yakutsk

sardaanafedorova@mail.ruЯНЦ КМПРоссияYakut Science Centre of Complex Medical ProblemsRussian FederationИнститут биохимии и генетики УНЦ АН РБРоссияUfa Federal Research CenterRussian FederationСВФУ им. М.К. АммосоваРоссияM.K. Ammosov North-Eastern Federal UniversityRussian Federation201924082025035055Copyright © Кононова С.К., Барашков Н.А., Пшенникова В.Г., Сидорова О.Г., Давыдова Т.К., Софронова С.И., Романова А.Н., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А., 20252025Кононова С.К., Барашков Н.А., Пшенникова В.Г., Сидорова О.Г., Давыдова Т.К., Софронова С.И., Романова А.Н., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А.Kononova S.K., Barashkov N.A., Pshennikova V.G., Sidorova O.G., Davydova T.K., Sofronova S.I., Romanova A.N., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://ymj.elpub.ru/jour/article/view/1002

В данном обзоре показаны примеры трансляции геномных исследований в практическую медицину двух распространенных в Европе наследственных заболеваний – аутосомно-рецессивного муковисцидоза и аутосомно-доминантной хореи Гентингтона. С развитием генетических технологий в Республике Саха (Якутия) трансляционная медицина становится реальностью, необходимо очертить подходы и проблемы в данной области исследований на примере частых в республике спиноцеребеллярной атаксии 1-го типа и аутосомно-рецессивной глухоты 1А типа.

The review presents examples of translation of genomic studies into practical medicine of two common in Europe hereditary diseases – autosomal recessive cystic fibrosis and autosomal dominant Huntington's Chorea. With the development of genetic technologies in the Republic Sakha (Yakutia), translational medicine is becoming a reality, it is necessary to outline the approaches and problems in this field of study on example of spinocerebellar ataxia type 1 and autosomal recessive deafness type 1A, frequent in the Republic.

трансляционная медицинанаследственные болезниДНК-диагностикапациентtranslational medicinehereditary diseasesDNA diagnosticspatientРабота выполнена при финансовой поддержке госзадания Минобрнауки РФ №6.1766.2017.ПЧ, проекта СВФУ им. М.К. Аммосова: «Генетические особенности населения Якутии: структура генофонда, адаптация к холоду, психогенетические характеристики, распространенность некоторых наследственных и инфекционных заболеваний» и программы биоресурсных коллекций ЯНЦ КМП (БРК: 0556-2017-0003); РФФИ (18-013- 00738_A, 18-015-00212_A).The study was supported by Ministry of Education and Science of Russian Federation #6.1766.2017 project M. K. Ammosov NEFU: "Genetic features of the population of Yakutia: the structure of the gene pool, adaptation to cold, psychogenetic characteristics, the prevalence of some hereditary and infectious diseases» , FASO (BRK:0556-2017- 0003) and RFBR (18-013-00738_A , 18- 015-00212_A).ReferencesАнализ распространенности мутации 35delG гена GJB2 у пациентов с нейросенсорной тугоухостью в Якутии / Н.А. Барашков [и др.] // Наука и образование.-2006.- Т.42.-С.129-133.Analysis of the prevalence of 35delG mutation of the GJB2 gene in patients with sensorineural hearing loss in Yakutia / N.A. Barashkov [et al.] // Science and education.-2006.-Vol. 42.-P. 129-133.Биоэтические проблемы пресимптоматической ДНК-диагностики спиноцеребеллярной атаксии 1-го типа в практике медико-генетической консультации Якутии / C.К. Кононова [и др.] // Медицинская генетика.-2005.- №12.-С.583-588.Bioethical problems of presymptomatic DNA diagnosis of spinocerebellar ataxia of the 1st type in the practice of medical genetic consultation of Yakutia / S.K. Kononova [et al.] // Medical genetics.-2005.-№12.-P. 583-588.Дифференциальная диагностика вилюйского энцефаломиелита: Изучение наследственной мозжечковой атаксии в Якутии / Г.Л. Зубри [и др.] //Актуальные проблемы вирусологии и профилактики вирусных заболеваний. М: АМН СССР., 1972.-С.201-210.Differential diagnosis of Vilyui encephalomyelitis: Study of hereditary cerebellar ataxia in Yakutia / G.L. Zubri [et al.] //Actual Problems of Virology and Prevention of Viral Diseases. M: – USSR Academy of Medical Sciences.-1972.-P. 201-210.Диагностика спиноцеребеллярной атаксии 1 типа в медико-генетической консультации Национального центра медицины Республики Саха (Якутия) / C.К. Кононова [и др.] // Проблемы вилюйского энцефаломиелита, нейродегенеративных и наследственных заболеваний нервной системы: Тез.докл. 2-й международной науч.-практ. конф. – Якутск, 2000.-С.84-85.Diagnosis of spinocerebellar ataxia type 1 in the medical genetic consultation of the National Center of Medicine of the Republic Sakha (Yakutia) / C.K. Kononovа [et al.] // 2nd International Scientific Conf. "Problems of Vilyui encephalomyelitis, neurodegenerative and hereditary diseases of the nervous system". –Yakutsk, 2000.-P. 84-85.Диагностика наследственных нарушений слуха в сурдологии / Т.Г. Маркова [и др.] // Несиндромальная тугоухость: учебное пособие.-М: ФГБОУ ДПО РМАНПО, 2018.-80с.Diagnosis of hereditary hearing disorders in audiology / T.G. Markova [et al.] // Non-syndromic hearing loss: a training manual.-M.:FGBOU DPO RMAPO,2018.-80 p.Иллариошкин С.Н. Болезнь Гентингтона как модель для изучения нейродегенеративных заболеваний / С.Н. Иллариошкин // Бюллетень национального общества по изучению болезни Паркинсона и расстройств движений.-2016. – №1.-С.3-11.Illarioshkin S.N. Huntington's disease as a model for the study of neurodegenerative diseases / S.N. Illarioshkin // Bulletin of the National society for the study of Parkinson's disease and movement disorders.-2016, №1.-P. 3-11.Иллариошкин С.Н. Новый механизм мутации у человека: экспансия тринуклеотидных повторов / С.Н. Иллариошкин, И.А. ИвановаСмоленская, Е.Д. Маркова // Генетика. -1995. -№ 31. -С. 1478–1489.Illarioshkin S.N. New mechanism of human mutation: expansion of trinucleotide repeats / S. N. Illarioshkin, I.A. Ivanova-Smolenskaya, E.D. Markova // Genetics. -1995. -№ 31. -P. 1478-1489.Иванова-Смоленская И.А. Клинические и молекулярно-генетические аспекты изучения наследственных заболеваний нервной системы / И.А. Иванова-Смоленская // Общие вопросы неврологии и психиатрии.-1996.- №1.- С.29-33.Ivanova-Smolenskaya I.A. Clinical and molecular genetic aspects of the study of hereditary diseases of the nervous system / I.A. Ivanova-Smolenskaya //General issues of neurology and psychiatry.-1996.- №1.-P. 29-33.Кусова З.А. Особенности массового скрининга новорожденных на муковисцидоз / З.А. Кусова, Н.Ю. Каширская, Н.И. Капранов // Русский медицинский журнал (Человек и лекарство. Часть 1).- 2010.-Т.18, №5.-С. 265–270.Kusova Z.A. Features of mass screening of newborns for cystic fibrosis / Z.A. Kusova, N.Yu. Kashirskaya, N.So. Kapranov // Russian medical journal (Man and medicine. Part 1).- 2010.-Vol. 18.№5.-P. 265-270.Некоторые биоэтические вопросы молекулярно - генетической диагностики аутосомно - рецессивной глухоты 1 а типа, распространенной в якутской популяции / C. К. Кононова [и др.] //Якутский медицинский журнал.- 2018.-№2.-С.79-82.Some bioethical issues of molecular genetic diagnosis of autosomal recessive deafness type 1 a, common in the Yakut population/ S.K. Kononova [et al.] //Yakut medical journal.-2018.-№2.-P. 79-82.Пальцев М.А. Молекулярная медицина: достижения и перспективы / М.А. Пальцев // Молекулярная медицина.- 2004.-№4.-С.3-8.Paltsev M.A. Molecular medicine: achievements and prospects / M.A. Paltsev// Molecular medicine.- 2004.-№4.-P. 3-8.Пальцев М.А. Трансляционная медицина – новый этап развития молекулярной медицины / М.А. Пальцев, Н.Н. Белушкина // Молекулярная медицина.-2012.-№4.-С.3-6.Paltsev M.A. Translational medicine is a new stage in the development of molecular medicine/ M. A. Paltsev, N.N. Belushkina // Molecular medicine.-2012.-№4.-P. 3-6.Пшенникова В.Г. Мутации генов GJB2 (Cx26), GJB6 (Cx30) и GJB3 (Cx31) у пациентов с врожденными нарушениями слуха в Якутии: автореф. дисс… канд. биол. наук / В.Г. Пшенникова. -Уфа, 2017. – 25с.Pshennikova V.G. Gene Mutations of GJB2 (Cx26), GJB6 (Cx30) and GJB3 (Cx31) in patients with congenital hearing impairment in Yakutia: thesis PhD (Biology) abstract / V.G. Pshennikova. –Ufa: 2017, 25C.Проблемы диагностики муковисцидоза и пути их решения в России / А.А. Баранов [и др.] // Педиатрическая фармакология.-2014. – Т.11, №6.-С.16-23.Problems of diagnosis of cystic fibrosis and their solutions in Russia / A.A. Baranov [et al.] // Pediatric pharmacology.-2014. -Vol. 11, №6.-P. 16-23.Пшенникова В.Г. Разработка алгоритма молекулярно-генетической диагностики аутосомно-рецессивной глухоты 1А типа в Республике Саха (Якутия) / В.Г. Пшенникова // VIII Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Молекулярная диагностика 2014». - М., 2014. – Т. 2. - Раздел 18. Медицинская генетика. - C.212-213.Development of the algorithm of molecular genetic diagnosis of autosomal recessive deafness type 1A in the Republic Sakha (Yakutia)/ V. G. Pshennikova // VIII All-Russian scientific and practical conference with international participation "Molecular diagnostics 2014". - M.-2014. – Vol. 2. - Section 18. Medical genetics. - C. 212-213.Трансляционная медицина – миф или реальность? / С.Сучков [ и др.] // Ремедиум.-2013.-№ 5.-С.8-17.Translational medicine – myth or reality? / S. Suchkov // Remedium.-2013.-№ 5.-P. 8-17.Шляхто Е.В. Трансляционные исследования как модель развития современной медицинской науки / Е.В.Шляхто// Трансляционная медицина.- 2014.-№1.-С.5-18.Shlyakhto E.V. Translational research as a model of development of modern medical science / E. V. Shlyakhto// Translational medicine.- 2014.- №1.-P. 5-18.Этические проблемы медико-генетического консультирования на примере хореи Гентингтона / С.А. Клюшников [и др.] // Российский медицинский журнал.- 2000. -№ 2. -С. 32–36.Ethical problems of medical genetic counseling on the example of Huntington's chorea / S.A. Klyushnikov [et al.] // Russian medical journal.- 2000. -№ 2. -P. 32-36.Autosomal dominant spinocerebellar ataxia (SCA) in a Siberian Founder Population: assignment to the SCA1 locus / A.Lunkes [et al.] // Experimental neurology.-1994.-Vol.126.-P.310-312.Autosomal dominant spinocerebellar ataxia (SCA) in a Siberian Founder Population: assignment to the SCA1 locus / A.Lunkes [et al.] // Experimental neurology.-1994.-Vol.126.-P.310-312.Autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) in Yakut population isolate in Eastern Siberia: extensive accumulation of the splice site mutation IVS1+1G>A in GJB2 gene as a result of founder effect /N.A. Barashkov [et al.] // Journal of Human Genetics. - 2011. - V.56. – №8. - P.631-639. Doi:10.1038/jhg.2011.72Autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) in Yakut population isolate in Eastern Siberia: extensive accumulation of the splice site mutation IVS1+1G>A in GJB2 gene as a result of founder effect /N.A. Barashkov [et al.] // Journal of Human Genetics. - 2011. - V.56. – №8. - P.631-639. Doi:10.1038/jhg.2011.72Connexins and deafness Homepage / E. Ballana [et al]. - World wide web.-URL: http://www.crg.es/deafness.Connexins and deafness Homepage / E. Ballana [et al]. - World wide web.-URL: http://www.crg.es/deafness.Defining translational research: Implications for training / D.M. Rubio [et al.] // Academic Med. - 2010. - Vol. 85. - P. 470–475.Defining translational research: Implications for training / D.M. Rubio [et al.] // Academic Med. - 2010. - Vol. 85. - P. 470–475.Expansion of an unstable trinukleotide CAG repeat in spinoserebellar ataxia type 1 / H.T. Orr [ et al.] // Nature Genet.-1993.- Vol.4.-P.221-226.Expansion of an unstable trinukleotide CAG repeat in spinoserebellar ataxia type 1 / H.T. Orr [ et al.] // Nature Genet.-1993.- Vol.4.-P.221-226.Five year study of prenatal testing for Huntington disease: demand, attitudes and psychological assessment / S. Adam [ et al.] // J Med Genet .-1993.-30.- Р. 549–556.Five year study of prenatal testing for Huntington disease: demand, attitudes and psychological assessment / S. Adam [ et al.] // J Med Genet .-1993.-30.- Р. 549–556.Gusella J.F. Genetic modifiers of Huntington’s disease/ J.F Gusella M.E.McDonald, J.-M. Lee // Mov. Disord. -2014. -V. 29. -P. 1359–1365.Gusella J.F. Genetic modifiers of Huntington’s disease/ J.F Gusella M.E.McDonald, J.-M. Lee // Mov. Disord. -2014. -V. 29. -P. 1359–1365.GJB2 mutation and degree of hearing loss: a multicenter study /R.L. Snoeckx [et al.] // Am.J.Hum.Genet.-2005.-Vol.77.-P.945-57.GJB2 mutation and degree of hearing loss: a multicenter study /R.L. Snoeckx [et al.] // Am.J.Hum.Genet.-2005.-Vol.77.-P.945-57.Huntington’s disease in Greece: the experience of 14 years / M. Panas [et al.] //Clin Genet.- 2011.- 80.-P. 586–590.Huntington’s disease in Greece: the experience of 14 years / M. Panas [et al.] //Clin Genet.- 2011.- 80.-P. 586–590.Identification of Cystic Fibrosis gene: Chromosome walking and jumping / J. M. Rommens [et al.] // Science. - 1989. - Vol. 245. - P. 1059-1065.Identification of Cystic Fibrosis gene: Chromosome walking and jumping / J. M. Rommens [et al.] // Science. - 1989. - Vol. 245. - P. 1059-1065.Identification of the cystic fibrosis gene: Cloning and characterization of complementary DNA / J. M Riordan [et al.] // Science. - 1989. - Vol. 245. - P. 1066–1073.Identification of the cystic fibrosis gene: Cloning and characterization of complementary DNA / J. M Riordan [et al.] // Science. - 1989. - Vol. 245. - P. 1066–1073.Identification of the cystic fibrosis gene: genetic analysis / B. S. Kerem [et al.] // Science. - 1989. - Vol. 245.- P. 1073-1080.Identification of the cystic fibrosis gene: genetic analysis / B. S. Kerem [et al.] // Science. - 1989. - Vol. 245.- P. 1073-1080.Introduction of mutation identification 35delG gene GJB2 in hereditary forms of hearing loss/deafness in the practice of medical-genetic counseling of the Republic of Sakha (Yakutia)/ N. A. Barashkov [et al.] // Yakut medical journal. – Appendix №3.-2005.-P. 90-93.Introduction of mutation identification 35delG gene GJB2 in hereditary forms of hearing loss/deafness in the practice of medical-genetic counseling of the Republic of Sakha (Yakutia)/ N. A. Barashkov [et al.] // Yakut medical journal. – Appendix №3.-2005.-P. 90-93.Kumar D. Genes and genomes in health and disease: an introduction / D. Kumar// Genomics and health in the developing world: Oxford monographs on medical genetics.-2012.- №62.- p.23Kumar D. Genes and genomes in health and disease: an introduction / D. Kumar// Genomics and health in the developing world: Oxford monographs on medical genetics.-2012.- №62.- p.23Lunt P. Diagnostic genetic laboratory services: models for the developing world / P.Lunt // Genomics and health in the developing world : Oxford monographs on medical genetics.-2012Lunt P. Diagnostic genetic laboratory services: models for the developing world / P.Lunt // Genomics and health in the developing world : Oxford monographs on medical genetics.-2012Molecular diagnosis of Huntington disease in Portugal: implications for genetic counselling and clinical practice / do Carmo Costa M [et al.] // European Journal of Human Genetics 2003 V. 11: 872–8Molecular diagnosis of Huntington disease in Portugal: implications for genetic counselling and clinical practice / do Carmo Costa M [et al.] // European Journal of Human Genetics 2003 V. 11: 872–8On the origin and frequency of the 35delG allele in GJB2-linked deafness in Europe /A. Anichkina [et al.] // Eur.J.Hum.Genet.-2001.- Vol.9.-P.151.On the origin and frequency of the 35delG allele in GJB2-linked deafness in Europe /A. Anichkina [et al.] // Eur.J.Hum.Genet.-2001.- Vol.9.-P.151.Petticrew M. Evidence, hierarchies, and typologies: horses for courses/ M. Petticrew, H. Roberts // J.Epidemiol.Commun.Health.-2003.- V.57.-P.527-9.Petticrew M. Evidence, hierarchies, and typologies: horses for courses/ M. Petticrew, H. Roberts // J.Epidemiol.Commun.Health.-2003.- V.57.-P.527-9.Predictive, prenatal and diagnostic genetic testing for Huntington’s disease: the experience in Canada from 1987 to 2000 / S. Creighton [ et al.] //Clin Genet.- 2003.-V. 63.-P. 462–475.Predictive, prenatal and diagnostic genetic testing for Huntington’s disease: the experience in Canada from 1987 to 2000 / S. Creighton [ et al.] //Clin Genet.- 2003.-V. 63.-P. 462–475.Strasser B. Perspectives: Molecular Medicine / B. Strasser// Science.-1999.- 286(5444).-P.1488-90.Strasser B. Perspectives: Molecular Medicine / B. Strasser// Science.-1999.- 286(5444).-P.1488-90.Stebnicki J.A. The culture of the deaf / J.A. Stebnicki, H.V. Coeling //.J Transcult Nurs. -1999.-Vol. 10(4).-P.350-7.Stebnicki J.A. The culture of the deaf / J.A. Stebnicki, H.V. Coeling //.J Transcult Nurs. -1999.-Vol. 10(4).-P.350-7.The relative frequency of CFTR mutation classes in European patients with cystic fibrosis/ K. De Boeck //J.of Cystic Fibrosis.-2010.-V.13.- №4.-P.403-9.The relative frequency of CFTR mutation classes in European patients with cystic fibrosis/ K. De Boeck //J.of Cystic Fibrosis.-2010.-V.13.- №4.-P.403-9.Unstable Triplet Repeat and Phenotypic Variability of Spinocerebellar Ataxia Type 1/ L.G. Goldfarb [et al. ] // Ann. Neurol.- 1996.- Vol.39.-№ 4.-P.500-506.Unstable Triplet Repeat and Phenotypic Variability of Spinocerebellar Ataxia Type 1/ L.G. Goldfarb [et al. ] // Ann. Neurol.- 1996.- Vol.39.-№ 4.-P.500-506.van Eldik T. Mental health problems of Dutch youth with hearing loss as shown on the Youth Self Report / T. van Eldik // Am Ann Deaf .-2005.-Vol.150(1).-P.11–16van Eldik T. Mental health problems of Dutch youth with hearing loss as shown on the Youth Self Report / T. van Eldik // Am Ann Deaf .-2005.-Vol.150(1).-P.11–16Working Group on Genetic Counselling and Testing of the European Huntington’s Disease Network (EHDN). Diagnostic genetic testing for Huntington’s disease/ D. Craufurd [et al.] // Pract. Neurol. -2015. -V. 15. -P. 80–84.Working Group on Genetic Counselling and Testing of the European Huntington’s Disease Network (EHDN). Diagnostic genetic testing for Huntington’s disease/ D. Craufurd [et al.] // Pract. Neurol. -2015. -V. 15. -P. 80–84.Web site NCBI (OMIM, MedLine, PubMed): http://www.ncbi:nlm.nlh.govWeb site NCBI (OMIM, MedLine, PubMed): http://www.ncbi:nlm.nlh.govWeb site https://www.ecfs.eu/projectsWeb site https://www.ecfs.eu/projects

The authors declare that there are no conflicts of interest present.